针对您提出的关于非婚生子女抚养权落户在父亲处但由女方照顾，如何起草协议的问题，以下是一个详细的协议起草指南，旨在帮助您明确双方的权利与义务，确保孩子的最佳利益得到保障。

协议标题

非婚生子女抚养权及照顾安排协议

协议双方

甲方（父亲）：[父亲姓名]，身份证号：[父亲身份证号] 乙方（母亲/照顾者）：[母亲姓名]，身份证号：[母亲身份证号]

协议背景

鉴于甲方与乙方为非婚生子女[子女姓名]的生物学父母，且该子女已落户于甲方户籍下，但实际由乙方负责日常照顾与抚养。为明确双方在子女抚养、教育、医疗等方面的责任与义务，特订立本协议。

协议内容

1. 抚养权归属：

   • 确认[子女姓名]的法定抚养权归甲方所有，但乙方作为实际照顾者，享有与甲方共同参与子女成长、教育的权利。

2. 日常照顾与抚养：

   • 乙方负责[子女姓名]的日常生活起居、教育辅导及基本医疗照顾。
   • 甲方应提供必要的经济支持，包括但不限于生活费、教育费、医疗费等，具体金额及支付方式双方另行协商确定，并作为本协议附件。

3. 探视权与交流：

   • 甲方享有定期探视[子女姓名]的权利，具体探视时间、方式由双方协商确定，确保不影响子女的正常生活与学习。
   • 双方应保持开放沟通，就子女的成长、教育等问题进行定期交流，共同为子女的最佳利益着想。

4. 教育与医疗决策：

   • 对于子女的重大教育决策（如选择学校、课外活动等）及医疗决策（如手术、长期治疗等），双方应共同协商，达成一致意见后执行。
   • 在紧急情况下，为保护子女生命健康，任何一方有权先行作出决策，但应及时通知另一方。

5. 法律责任与义务：

   • 双方均应遵守国家法律法规，不得有虐待、遗弃子女等违法行为。
   • 如因一方过失导致子女权益受损，应承担相应的法律责任。

6. 协议变更与解除：

   • 本协议一经签订，非经双方协商一致并书面确认，不得擅自变更或解除。
   • 如遇特殊情况需变更或解除协议，双方应提前协商，并就变更或解除后的相关事宜达成一致意见。

7. 争议解决：

   • 双方因执行本协议发生争议，应首先通过友好协商解决；协商不成时，可提交至有管辖权的人民法院诉讼解决。

协议生效与签署

本协议自双方签字（或盖章）之日起生效，一式两份，甲乙双方各执一份，具有同等法律效力。

甲方（父亲）签字：[父亲手写签名] 日期：[签署日期]

乙方（母亲/照顾者）签字：[母亲手写签名] 日期：[签署日期]

注意事项

• 在起草协议时，建议双方充分沟通，确保协议内容真实反映双方意愿，且符合法律法规要求。
• 协议中的具体条款（如抚养费金额、支付方式等）应根据双方实际情况协商确定，必要时可咨询专业律师意见。
• 协议签署后，双方应严格遵守协议约定，共同为子女的健康成长负责。

希望以上指南能对您有所帮助，如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时咨询专业律师。