贪污所得的钱款，其最终去向主要取决于款项的性质及司法程序的处理结果，一般会上缴国库。以下是对此问题的详细分析：
一、犯罪所得的处理
司法认定：
- 在贪污案件中，若款项被法院最终判决认定为犯罪所得，即实施贪污犯罪所获得的财物，那么这些钱款将依法由法院处理。
上缴国库：
- 根据相关法律规定，犯罪所得应上缴国库。这是国家对贪污犯罪行为的一种经济制裁方式，也是恢复被贪污款项原有公共属性的必要手段。例如，在天津市第一中级人民法院对海南省原副省长冀文林受贿案的宣判中，法院判决认定的受贿财物就依法上缴了国库。
二、违纪所得的处理
纪检监察机关认定：
- 若贪污款项不构成犯罪，但被纪检监察机关认定为违反党纪政纪行为所得，即违纪所得，那么这些钱款将由纪检监察机关处理。
收缴并上缴国库：
- 纪检监察机关会依纪收缴违纪所得，并上缴国库。这是对违纪行为的一种经济处罚，也是维护党纪政纪严肃性的重要举措。例如，因严重违纪被断崖式“降级”的云南省委原常委、昆明市委原书记张田欣和江西省委原常委、秘书长赵智勇，中央纪委在发布两人的处分通报时，就采用了“收缴其违纪所得”的表述。
三、处理流程与依据
暂扣与移交：
- 在查办贪污案件的过程中，涉案款物通常会被纪检监察机关或司法机关暂扣。若款项被认定为犯罪所得，案件移交司法机关的同时，相关款物也会一并移交司法机关依法处理。
处理依据：
- 纪检监察机关处理违纪所得主要依据现行的党纪法规和国家法律法规，如《中国共产党纪律处分条例》、《中华人民共和国行政监察法》及其实施条例、《监察机关没收追缴和责令退赔财物办法》等。这些法规为纪检监察机关提供了明确的处理依据和程序。
四、特殊情况的处理
责令退赔：
- 若贪污款项涉及违反规定挥霍浪费国有资产等情形，纪检监察机关可能会责令相关人员退赔应由个人承担的费用。这是对违纪行为的一种经济补偿方式，也是恢复被贪污款项原有用途的必要手段。
拍卖变现：
- 对于追缴或责令退赔的款物中依法不应当退回、退赔，或者因客观原因不能退回、退赔的物品，纪检监察机关会通过拍卖等方式变现，并将变价款上缴国库。这是对物品类涉案款物的一种有效处理方式。
建议：
- 对于涉及贪污案件的当事人或相关人员，应积极配合司法机关和纪检监察机关的调查工作，如实交代涉案款物的来源和去向。
- 对于普通公民而言，应增强法律意识，远离任何形式的贪污腐败行为。若发现身边存在贪污腐败现象，应及时向有关部门举报，以维护社会的公平正义和法律的尊严。
综上所述，贪污所得的钱款最终去向主要取决于款项的性质及司法程序的处理结果。无论是犯罪所得还是违纪所得，最终都将上缴国库或通过其他合法方式进行处理。