目标责任书纠纷在特定情况下是适用商事调解的。以下从不同角度为您详细分析：

一、商事调解的适用范围

商事调解作为一种非诉讼纠纷解决方式，其适用范围广泛，包括但不限于合同纠纷、债权债务纠纷、股权纠纷等商事领域内的争议。目标责任书纠纷，若其性质属于商事合同纠纷或与商事活动紧密相关，且双方当事人有意愿通过调解方式解决争议，那么该纠纷是可以适用商事调解的。

二、目标责任书纠纷的性质

目标责任书通常是企业或组织内部为了明确目标、责任和考核标准而签订的一种文件。当目标责任书纠纷发生时，其性质可能涉及合同违约、责任划分不清等问题。如果这些纠纷不涉及刑事犯罪或行政处罚，且双方当事人愿意通过协商和调解解决争议，那么商事调解就是一个可行的选择。

三、商事调解的优势

1. 灵活性：商事调解不受严格程序限制，双方当事人可以更灵活地安排调解时间、地点和方式，有助于快速解决纠纷。
2. 保密性：商事调解过程通常保密，有助于保护双方当事人的商业秘密和隐私。
3. 成本效益：相比诉讼程序，商事调解通常成本更低，时间更短，有助于双方当事人节省时间和金钱。
4. 维护关系：商事调解强调双方当事人的合作和协商，有助于维护或修复双方之间的商业关系。

四、适用商事调解的具体条件

1. 双方当事人自愿：商事调解必须基于双方当事人的自愿，任何一方不得强迫另一方接受调解。
2. 纠纷性质适宜：目标责任书纠纷的性质应适宜通过调解方式解决，如涉及合同解释、责任划分等。
3. 调解机构专业：选择具有专业性和公信力的调解机构进行调解，以确保调解结果的公正性和有效性。

五、实际操作建议

1. 评估纠纷性质：在决定是否适用商事调解前，双方当事人应首先评估纠纷的性质和适宜的解决方式。
2. 选择调解机构：根据纠纷的性质和双方当事人的需求，选择合适的调解机构进行调解。
3. 准备调解材料：双方当事人应准备相关的调解材料，如目标责任书、相关证据等，以便调解机构更好地了解纠纷情况。
4. 积极参与调解：在调解过程中，双方当事人应积极参与，诚实表达自己的意见和诉求，共同寻求解决方案。

总结来看，目标责任书纠纷在双方当事人自愿、纠纷性质适宜且选择专业调解机构的情况下，是适用商事调解的。如果您在目标责任书纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。