针对您提出的“动态监控人员发现驾驶员存在超速行驶，交通部门会罚款企业多少”的问题，这并非一个固定的罚款数额，而是会根据企业未有效执行交通违法动态信息处理制度的具体情况，以及相关法律法规的规定来进行判定和处罚。

首先，需要明确的是，道路运输企业有责任建立健全并严格落实动态监控管理相关制度，这包括对驾驶员超速行驶等违法行为的实时监控、提醒、处理和记录存档等。如果企业未能有效执行这些制度，交通部门有权对其进行处罚。

具体到罚款数额，它会因企业违规的严重程度、违规次数、是否造成严重后果等多种因素而有所不同。例如，在某些案例中，如果企业未有效执行交通违法动态信息处理制度，且存在多次驾驶员超速报警而未进行适当处理的情况，交通部门可能会对企业开出一定数额的罚单，如某案例中企业被罚款1000元。

此外，除了罚款外，交通部门还可能要求企业立即整改，如提高车辆动态监控工作实效、消除安全隐患等，并可能针对企业对驾驶员交通违法处理率低于一定标准（如90%）的违法行为，开具《责令改正通知书》。

因此，无法给出一个具体的罚款数额，但可以明确的是，如果企业未能有效执行交通违法动态信息处理制度，导致驾驶员超速行驶等违法行为未得到及时处理，交通部门将依法对企业进行处罚，并可能要求企业进行整改。

为了确保道路运输安全，企业应严格落实动态监控管理相关制度，对驾驶员的违法行为进行及时、有效的处理，以避免不必要的法律风险和经济损失。