农村土地征用后，土地承包经营权人的利益主要通过以下方式得到保障：

1. 依法获得补偿
   根据《土地管理法》及《农村土地承包法》，土地被征用时，承包经营权人有权获得土地补偿费、安置补助费、地上附着物及青苗补偿费等。补偿标准需符合省级政府制定的区片综合地价，确保与市场价值匹配。若补偿方案显失公平，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

2. 参与补偿方案制定与监督
   征地前，县级以上政府需发布征地公告，并组织听证会，承包经营权人有权参与讨论补偿方案。若发现补偿程序违法（如未公告、未评估），可要求政府停止征地行为，或通过法律途径主张权利。

3. 优先安置与就业保障
   根据《土地管理法实施条例》，征地后需优先安排被征地农民的社会保障费用，包括养老保险、医疗保险等。部分地区还提供就业培训或优先录用机会，确保承包经营权人基本生活不受影响。

4. 承包权流转或置换权益
   若征地后仍有部分土地未被占用，承包经营权人可与集体协商调整承包地块；若完全失去土地，可要求集体提供等值土地置换，或依法流转剩余承包期限内的权益，获得经济补偿。

5. 法律救济途径
   若对征地程序、补偿标准有异议，承包经营权人可：

• 向县级以上政府申请行政复议；
  
• 直接向法院提起行政诉讼，要求撤销违法征地决定或重新确定补偿；
  
• 通过信访、调解等非诉方式解决争议，但需注意时效限制（如行政诉讼需在知道征地行为后6个月内提起）。

温馨提示：实践中，部分地区存在补偿款截留、程序不透明等问题。建议承包经营权人在征地公告发布后，及时收集土地权属证明、地上附着物清单等证据，并主动联系当地自然资源部门或司法所，确保权益不受侵害。若有具体纠纷，可直接向我咨询，我会结合地方政策为您详细分析。