分公司可以进行技术合同登记。具体分析如下：

一. 分公司进行技术合同登记的可行性

• 根据《技术合同认定登记管理办法》的相关规定，技术合同认定登记实行按地域一次登记制度。这意味着技术合同的登记主要依据地域原则，而非必须是总公司或特定主体。
• 对于总公司在外地，而分公司在济宁的情况，只要分公司符合技术合同认定登记的相关条件，就可以在济宁进行技术合同的认定登记。

二. 分公司进行技术合同登记时可能的手续

• 虽然具体的手续可能因地区或登记机构的不同而有所差异，但一般而言，分公司进行技术合同登记时，可能需要提供分公司的营业执照、技术合同文本、相关证明材料等。
• 此外，如果分公司是代表总公司签订技术合同，可能还需要提供总公司的授权委托书或相关证明文件，以证明分公司有权限进行该技术合同的签订和登记。

综上所述，分公司是可以进行技术合同登记的，只要符合相关条件并按照当地登记机构的要求提供必要的材料和手续即可。如有进一步需要，您可以继续咨询我。