无证驾驶摩托车发生交通事故，不会直接扣除小车驾驶证的分数。摩托车和小车是不同的准驾车型，驾驶证记分是针对特定准驾车型的违法行为记录在对应的驾驶证上。下面我详细解释一下：

1. 无证驾驶摩托车的处罚：

   • 无证驾驶摩托车被查到，会对骑摩托车的人进行处罚，一般会扣留摩托车，并处200元以上2000元以下罚款，还可能会有15日以下拘留。
   • 如果驾驶人只有小车驾驶证而没有摩托车驾驶证，那么驾驶摩托车就属于驾驶与准驾车型不符的机动车，这种情况下会被扣12分（扣的是小车驾驶证的分），同时还会面临罚款、暂扣机动车等处罚。

2. 对小车驾驶证的影响：

   • 小车的驾驶证只记录小车相关的交通违法记分情况。因此，无证驾驶摩托车本身不会直接扣除小车驾驶证的分数。
   • 但是，如果因为无证驾驶摩托车导致交通事故，并且在事故中有责任，这可能会影响后续的保险理赔等一系列事情。同时，无证驾驶本身就是很危险的行为，强烈建议遵守交通规则，依法取得相应准驾车型的驾驶证后再合法上路骑行或开车。

综上所述，无证驾驶摩托车发生交通事故不会直接扣除小车驾驶证的分数，但会面临其他严重的法律后果。因此，请务必遵守交通规则，确保自己和他人的安全。如果有任何关于交通事故或税务纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。