结论前置：在现行法律框架下，免予起诉（现称为不起诉）通常不会留下案底，但具体情况需根据不起诉的类型和案件性质综合判断。

一、不起诉的类型与案底情况

根据现行《刑事诉讼法》，不起诉分为法定不起诉、酌定不起诉和证据不足不起诉三种情况。这些决定均由人民检察院作出，意味着犯罪嫌疑人未经法院审判定罪。

1. 法定不起诉：

   • 当案件存在情节显著轻微、危害不大等不构成犯罪的情形，或犯罪已过追诉时效期限、经特赦令免除刑罚等，人民检察院应当作出不起诉决定。
   • 案底情况：此情况下，犯罪嫌疑人不构成犯罪，不会留下案底。

2. 酌定不起诉：

   • 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
   • 案底情况：尽管理论上这种情况构成犯罪，但实践中很多地方不将其认定为有案底，各地执行标准存在差异。不过，若因其他严重违法记录或行政处罚等被决定不起诉的，可能会有相关记录存档。

3. 证据不足不起诉：

   • 若二次补充侦查后，人民检察院仍认为证据不足，不符合起诉条件，应作出不起诉决定。
   • 案底情况：因现有证据无法证明犯罪嫌疑人构成犯罪，故不会留下案底。

二、“免于起诉”的历史与现状

“免于起诉”是旧《刑事诉讼法》中的概念，已在1996年修订时被废除，并被不起诉制度所取代。原“免于起诉”指的是人民检察院对已构成犯罪但依法不需要判处刑罚或应免除刑罚的案件所作的处理决定。若当时基于此被认定有罪但免予刑事处罚，则可能留有案底，因为本质上是被认定构成了犯罪。但在当前法律体系下，这一概念已不再使用，取而代之的是不起诉制度。

三、特殊情况说明

虽然一般情况下不起诉不会留下案底，但在某些特定情况下，如涉及国家安全、政治敏感等特殊领域，或犯罪嫌疑人因其他原因（如虽犯罪情节轻微但有严重违法记录或行政处罚等）被决定不起诉的，可能会有相关记录存档。此外，在政审、从业资格审查等场合，相关部门可能会了解到曾经有过不起诉的经历。

四、法律建议

1. 了解自身情况：对于个人而言，如需了解自身是否有案底或担心未来可能受到的影响，建议仔细回顾自己的案件情况，包括不起诉的类型和原因。
2. 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供准确的法律意见和指导。
3. 注意法律后果：虽然不起诉通常不会留下案底，但某些特殊情况下可能会有相关记录存档。因此，在日常生活中应遵守法律法规，避免涉及任何违法犯罪行为。

综上所述，不起诉在大多数情况下不会留下案底，但具体是否会有案底还需结合案件性质、法律规定及地方执行标准等因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。