转账备注“双方无争议货款两清”是具有一定法律效力的，但并非绝对有效。以下从不同角度为你详细分析：
法律效力体现
作为款项性质和用途的说明：转账备注可以看作是对款项性质和用途的一种说明。在货物买卖合同纠纷中，如果转账时备注了“双方无争议货款两清”，这在一定程度上能够证明双方对于该笔款项的性质和用途已经达成了一致意见，即该笔款项是用于支付货款，并且双方对此无争议。
作为纠纷处理中的证据：在发生纠纷时，转账备注可以作为证据使用。如果一方主张货款已经支付，而另一方否认，那么转账备注“双方无争议货款两清”就可以作为证明货款已经支付的有力证据。
法律效力限制
其他证据可能推翻备注内容：虽然转账备注具有一定的法律效力，但并非绝对有效。如果另一方能够提供其他证据来推翻备注内容，比如双方之前的聊天记录、合同条款等，证明该笔款项并非货款或者双方对于货款存在争议，那么转账备注的证明力就会受到影响。
法院会综合全案证据判定：在处理货物买卖合同纠纷时，法院不会仅仅依据转账备注来认定款项的性质和用途。而是会结合全案的其他证据，比如合同、发票、送货单等，进行综合判断。因此，即使转账备注了“双方无争议货款两清”，也不能保证法院一定会认定货款已经支付且双方无争议。
法律建议
保留完整证据链：为了确保自己的权益得到保障，建议在转账时除了备注款项性质和用途外，还应保留完整的证据链，比如合同、发票、送货单等。这样，在发生纠纷时，就能够提供充分的证据来证明自己的主张。
及时咨询专业律师：如果对于转账备注的法律效力存在疑问或者发生了货物买卖合同纠纷，建议及时咨询专业律师。律师能够根据你的具体情况，提供专业的法律意见和帮助，确保你的权益得到最大程度的保障。
举例说明：假设A公司向B公司购买了一批货物，并通过银行转账支付了货款。在转账时，A公司在备注中写明了“双方无争议货款两清”。后来，B公司却否认收到了货款，并主张A公司还欠其货款。在这种情况下，A公司就可以提供转账备注作为证据，证明货款已经支付。但如果B公司能够提供其他证据，比如双方之前的聊天记录或者合同条款等，证明A公司并未支付全部货款或者双方对于货款存在争议，那么转账备注的证明力就会受到影响。此时，法院就会结合全案的其他证据进行综合判断。