关于摩托车罚款单滞纳金是否会超过本金的问题，我可以明确地告诉您：摩托车罚款单的滞纳金不会超过本金。这一规定是基于我国多部法律条款的明确规定，旨在保护当事人的合法权益，避免因滞纳金过高而造成不合理的经济负担。

法律依据

1. 《中华人民共和国行政处罚法》第七十二条：该条款规定，当事人到期不缴纳罚款的，每日按罚款数额的百分之三加处罚款，但加处罚款的数额不得超出罚款的数额。

2. 《中华人民共和国行政强制法》第四十五条：此条款也明确指出，加处罚款或者滞纳金的数额不得超出金钱给付义务的数额，即罚款本金。

3. 《道路交通安全违法行为处理程序规定》：该规定同样指出，当事人逾期不履行行政处罚决定的，到期不缴纳罚款的，每日按罚款数额的3%加处罚款，但加处罚款总额不得超出罚款数额。

滞纳金计算方式

滞纳金是按照罚款金额的一定比例（每日百分之三）来计算的。例如，如果您的摩托车因交通违法行为被处以200元罚款，那么从逾期之日起，每日将产生6元的滞纳金（200元×3%）。但无论逾期时间多长，滞纳金的总额都不会超过这200元罚款本金。

滞纳金的目的与避免策略

滞纳金作为对逾期不履行行政处罚决定的一种经济惩罚，其主要目的是督促当事人尽快履行缴纳罚款的义务。为了避免不必要的滞纳金支出，我建议您：

• 及时查询与处理违章：定期通过官方渠道查询车辆违章记录，并在收到罚单后及时处理，确保在规定时间内缴纳罚款。
• 注意税费缴纳期限：除了罚款外，摩托车车主还需关注车辆购置税、车船税等税费的缴纳期限，确保按时足额缴纳。
• 特殊情况及时沟通：若因特殊原因无法按时缴纳相关费用，应提前与相关部门联系，说明情况并寻求解决方案。

综上所述，摩托车罚款单的滞纳金不会超过本金，这是由我国多部法律明确规定的。作为车主，您应充分了解并遵守相关规定，及时缴纳罚款和税费，以避免产生不必要的滞纳金支出。