针对您提出的“村民代表占用集体土地怎么处理”的问题，这是一个涉及集体土地权益保护的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、处理流程
沟通协商：
- 集体组织应首先派出代表与占用土地的村民代表进行诚恳的沟通和友好的协商。
- 在协商过程中，明确向村民代表说明土地的重要性以及他们侵占行为的错误性，要求他们立刻停止侵占行为，并尽最大努力恢复土地的原状。
发出停止侵占通知：
- 若协商无果，集体组织应依据《土地管理法》等相关法规，向占地村民代表发出停止侵占土地的通知，要求其归还土地。
申请乡镇人民政府处理：
- 若村民代表不听从通知，集体组织可向乡镇人民政府等相关部门反映情况。
- 乡镇人民政府将依法对案件进行调查核实，并责令村民代表在规定的期限内改正错误，或拆除在集体土地上违法搭建的建筑。
向法院起诉：
- 若村民代表仍拒不履行责任，集体组织可向人民法院提起诉讼。
- 法院将根据具体情况作出公正的判决，要求村民代表承担相应的法律责任，如恢复土地原状、赔偿损失等。
二、法律后果
民事责任：
- 集体作为土地所有权人，有权要求占用人返还土地，并赔偿因占用行为给集体造成的损失，如土地上农作物受损、土地闲置导致的收益损失等。
行政责任：
- 依据《土地管理法》，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令占用人退还非法占用的土地。
- 若在该土地上进行了违法建设，可责令限期拆除新建的建筑物和其他设施；逾期不拆除的，可能会被强制拆除。
- 情节严重的，还可对占用人处以罚款。
刑事责任：
- 若占用行为构成犯罪，如占用耕地数量较大，造成耕地大量毁坏等情况，将依据《刑法》追究刑事责任，可能面临有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。
三、注意事项
程序合法：
- 在整个处理过程中，必须确保程序合法合规，以维护集体土地的合法权益。
证据收集：
- 集体组织应注意收集土地权属证明、侵占事实等相关证据，以保障集体合法权益。
后续处理：
- 处理完占用问题后，还需关注被占土地的恢复原状责任界定、经济损失赔偿范围和标准等后续问题。
综上所述，处理村民代表占用集体土地的问题需要遵循一定的法律程序和原则。通过沟通协商、发出停止侵占通知、申请乡镇人民政府处理以及向法院起诉等步骤，可以有效维护集体土地的合法权益。同时，也要关注处理过程中的法律后果和注意事项，确保整个处理过程的合法性和有效性。