股东用个人账户偿还公司工程款，单次行为通常不认定为财产混同。具体分析如下：

一. 财产混同的认定

1. 定义与标准：财产混同是指公司股东的财产与公司的财产界限不清，导致公司法人独立地位的丧失，进而可能损害公司及其他债权人的利益。在司法实践中，若股东与公司之间存在持续的、无法区分的财产混同情形，股东可能需要对公司债务承担连带责任。这通常涉及资金、财务管理、业务、资产及人员等多个方面的混同。

2. 单次行为与持续混同的区别：根据公域知识中的案例，股东仅使用个人账户单次偿还公司部分借款，并无其他证据证明导致股东财产与公司财产混同而无法区分的，不构成滥用情形，股东不因此对公司债务承担连带责任。这表明，单次使用个人账户偿还公司款项的行为，并不足以证明公司财产与股东个人财产发生了持续的、无法区分的混同。

二. 法律依据

• 《中华人民共和国公司法(2023年修订)》第二十一条规定：“公司股东应当遵守法律、行政法规和公司章程，依法行使股东权利，不得滥用股东权利损害公司或者其他股东的利益；不得滥用公司法人独立地位和股东有限责任损害公司债权人的利益。”此条款强调了股东不得滥用公司法人独立地位和股东有限责任的原则。
• 同时，根据该法条及相关案例，只有在股东实施了滥用公司法人独立地位及股东有限责任的行为，且严重损害了公司债权人利益的情况下，才能由股东对公司债务承担连带责任。

三. 结论与应用

• 结论：因此，股东用个人账户偿还公司工程款，若仅为单次行为，且没有其他证据证明股东与公司之间存在持续的财产混同情形，通常不被认定为财产混同。
• 应用：在实际操作中，公司应建立健全的财务管理制度，确保公司财产与股东个人财产严格区分。股东也应避免利用个人账户或其他不规范手段操作公司资金，以确保公司资产的独立性和公司法人地位的完整性。

综上所述，股东用个人账户偿还公司工程款，单次行为通常不认定为财产混同。但公司应谨慎处理股东与公司之间的资金往来，避免发生不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。