结论前置：公司转为合伙企业时，员工处理需结合法律关系变更、劳动合同履行及员工权益保护综合判断，具体分以下情况处理：

1. 劳动关系主体未变更：原劳动合同继续有效

• 法律逻辑：根据《劳动合同法》第34条，用人单位发生合并、分立等情形，原劳动合同继续有效，由承继其权利义务的用人单位继续履行。
• 操作要点：
  • 若公司转为合伙企业后，原公司主体未注销（如仅变更组织形式），员工与原公司的劳动合同无需重新签订，劳动关系自动延续。
  • 合伙企业需继续履行原劳动合同约定的工资、社保、福利等义务，不得以组织形式变更为由单方解除合同。
• 风险提示：若合伙企业拒不履行合同，员工可主张继续履行或要求支付经济补偿（按工作年限×月工资计算）。

2. 劳动关系主体变更：需协商重新签订合同

• 法律逻辑：若公司转为合伙企业后，原公司主体注销，劳动关系需转移至新设立的合伙企业。此时需区分两种情形：
  • 情形一：员工同意继续工作，需与合伙企业重新签订劳动合同，明确工作内容、薪资等条款。
  • 情形二：员工不同意继续工作，可视为原公司提出解除合同，需支付经济补偿（N+1标准，N为工作年限）。
• 操作要点：
  • 合伙企业应提前30日书面通知员工或支付代通知金（1个月工资），并协商补偿方案。
  • 若未协商一致强行解除合同，可能构成违法解除，员工可主张2N赔偿金（双倍经济补偿）。

3. 特殊情形：员工选择不继续履行合同

• 法律逻辑：根据《劳动合同法》第38条，若组织形式变更导致劳动合同履行条件发生重大变化（如工作地点、岗位调整），员工可拒绝并主张解除合同，同时要求经济补偿。
• 操作要点：
  • 员工需证明变更对劳动合同履行产生实质影响（如合伙企业注册地变更导致通勤成本大幅增加）。
  • 补偿标准为工作年限×月工资，月工资高于当地社平工资3倍的，按3倍封顶计算。

4. 实务建议：合规操作降低风险

• 对合伙企业：
  1. 提前与员工沟通变更事宜，出具书面告知书；
  2. 协商一致后签订变更协议或新合同，明确权利义务；
  3. 依法办理社保、公积金账户转移手续。
• 对员工：
  1. 核查新主体是否具备用工主体资格（合伙企业需依法登记）；
  2. 拒绝签署空白合同或降低待遇的协议；
  3. 保留原合同、工资流水等证据，以备维权。

总结：公司转为合伙企业时，员工处理需以“劳动关系是否延续”为核心，优先通过协商解决。若发生争议，可依据《劳动合同法》第34条、38条、46条主张权益。如有具体案例或合同条款需进一步分析，可直接向我提问。