辞退和自动离职各有利弊，选择哪种方式更好需根据具体情况判断。以下是对这两种方式的详细分析：
辞退
经济补偿：
- 合法辞退：如果员工因严重违反单位规章制度等情况被合法辞退，单位通常无需支付经济补偿。
- 违法辞退：如果单位违法解除劳动合同，员工有权要求单位支付赔偿金，赔偿金标准一般是经济补偿标准的二倍。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
手续与证明：
- 辞退手续一般由单位办理，相对规范，能明确责任归属。被辞退后，员工通常会获得相应的辞退证明，这在再就业等方面可能有一定影响。
法律后果：
- 如果单位合法辞退员工，员工需接受这一结果。如果单位违法辞退，员工可以通过法律途径维护自己的权益。
自动离职
经济影响：
- 自动离职往往没有单位开具的正规手续，员工可能无法获得经济补偿。此外，自动离职可能会影响社保等权益的衔接，例如可能导致社保断缴等问题。
手续与证明：
- 自动离职后，员工可能需要花费更多精力来证明之前的工作经历等情况，这在再就业时可能带来不便。
法律后果：
- 从单位角度看，若员工自动离职，单位可能以旷工等理由解除劳动合同，并且可能不支付经济补偿。但如果员工有合理原因提前告知单位并办理相关手续的自动离职，比如因家庭重大变故等，单位也可能会给予理解并妥善处理。
综合建议
- 如果员工与单位没有较大矛盾，且想顺利结束劳动关系：能协商好由单位辞退并给予适当补偿等是比较好的选择。这样，员工可以获得经济补偿，同时也有明确的辞退证明，便于再就业。
- 如果员工觉得自身有过错，不想给单位留下不良印象等：也可考虑按单位规定办理自动离职手续。但在此之前，员工应确保自己的权益不受损，提前了解对社保、工资结算等方面的影响，并尽量与单位协商好相关事宜。
无论选择哪种方式，员工都应了解自己的权益和义务，并遵循法定程序办理离职手续。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。