睡过头只能算旷工处理是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、从公司规章制度角度
若公司规章制度合法且明确规定：
- 若公司规章制度经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）、已向员工公示，且明确规定“未按时间到岗且无合理原因即为旷工”，那么睡过头很可能被认定为旷工，公司据此进行旷工处理是合法的。
- 例子：某公司规章制度规定“员工迟到超过30分钟且未提前请假，视为旷工半天”。若员工因睡过头迟到超过30分钟且未请假，公司按此规定处理，合法有效。
若公司规章制度不合法或未公示：
- 若公司规章制度制定程序不合法（如未民主制定）、未向员工公示，或规定内容不合理（如“迟到1分钟即算旷工”），则公司不能轻易依据该规定认定睡过头为旷工，否则可能面临法律风险。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，并将规章制度公示或告知劳动者。
二、从员工实际情况角度
一般情况：
- 睡过头通常不属于有正当理由的缺勤。若员工未提前请假或请假未获批准，公司按旷工处理是合理的。
特殊情况：
- 若因连续加班导致过度疲劳、突发疾病等特殊原因睡过头，且员工及时向单位说明情况（如提供医院证明、加班记录等），单位可能会考虑实际情况不予认定为旷工，或从轻处理。
- 例子：员工因前一天连续加班至凌晨，第二天睡过头迟到。若员工及时向单位说明情况并提供加班记录，单位可能不予认定为旷工。
三、从法律后果角度
若公司合法处理：
- 若公司依据合法有效的规章制度对睡过头的员工按旷工处理，且处理程序合法（如通知员工、听取申辩等），则员工需接受处理结果，否则可能面临更严重的法律后果（如被解除劳动合同）。
若公司违法处理：
- 若公司未依据合法有效的规章制度，或处理程序不合法（如未通知员工、未听取申辩等），对睡过头的员工按旷工处理，员工有权通过劳动仲裁等法律途径维护合法权益，要求公司撤销处理决定或赔偿损失。
四、员工应对措施
及时沟通：
- 睡过头后，员工应立即与公司联系，说明情况并询问是否可以晚点到岗或采取其他补救措施（如补班、调休等）。
了解规定：
- 员工应查看劳动合同和公司规章制度，明确关于旷工和迟到的具体规定，以便更好地维护自身权益。
保留证据：
- 若因特殊原因睡过头，员工应保留相关证据（如医院证明、加班记录等），以便在需要时向单位说明情况。
维护权益：
- 若对单位处理结果有异议，员工可与单位协商沟通；协商不成，可通过劳动仲裁等法律途径维护合法权益。
总结：睡过头是否算旷工及公司处理是否合法，需结合公司规章制度、员工实际情况及法律后果综合判断。员工应及时与公司沟通、了解规定、保留证据，并在必要时通过法律途径维护自身权益。如有具体法律问题，可直接向我咨询。