事业单位人员吸毒两次且纪委已移交单位处理的，单位应依据相关规定和程序，视情节轻重给予相应的处分，处分类型包括警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除。具体分析如下：

一、处理依据

1. 法律法规：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关法律法规，事业单位工作人员有违法违纪行为，应当承担纪律责任的，依照该规定给予处分。吸毒行为属于违法违纪行为，因此事业单位有权对吸毒人员进行处分。
2. 单位规章制度：事业单位通常会有自己的规章制度，对员工的违法违纪行为进行明确规定。这些规章制度也是单位处理吸毒人员的重要依据。

二、处理程序

1. 调查核实：单位在接到纪委移交的材料后，应首先对吸毒人员的吸毒行为进行调查核实，确保事实清楚、证据确凿。
2. 提出处理意见：根据调查核实的结果，单位应提出处理意见，明确处分的类型和期限。
3. 集体讨论决定：处理意见应提交单位领导班子集体讨论决定，确保处理决定的公正性和合理性。
4. 通知本人并听取陈述申辩：单位应将处理决定通知吸毒人员本人，并听取其陈述和申辩。如果吸毒人员对处理决定有异议，可以提出申诉。
5. 执行处理决定：如果吸毒人员未提出申诉或申诉被驳回，单位应执行处理决定，给予相应的处分。

三、处分类型及后果

1. 警告：对于吸毒情节较轻的，单位可以给予警告处分。警告处分通常会对员工的声誉和职业发展产生一定影响。
2. 记过：对于吸毒情节较重的，单位可以给予记过处分。记过处分会对员工的晋升、评优等方面产生较大影响。
3. 降低岗位等级或者撤职：对于吸毒情节严重且造成不良影响的，单位可以给予降低岗位等级或者撤职处分。这种处分会对员工的职业发展和经济收入产生严重影响。
4. 开除：对于吸毒情节特别严重且屡教不改的，单位可以给予开除处分。开除处分意味着员工将失去事业单位的工作岗位和相应的福利待遇。

四、特殊情况处理

1. 主动交代问题：如果吸毒人员在单位调查前主动交代吸毒问题，并积极配合调查的，单位可以从轻或者减轻处分。
2. 立功表现：如果吸毒人员在处分期间有立功表现的，单位可以提前解除处分。

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