针对您提出的“未确权有争议的承包耕地怎么处理”的问题，这是一个涉及土地权属和承包权益的复杂问题，需要依据相关法律法规和政策规定来妥善处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、协商解决
首先，我建议您与争议方秉持互谅互让的原则，通过友好协商来解决问题。在协商过程中，双方可以心平气和地交流各自对土地的诉求和想法，努力明确土地的最终归属以及双方应享有的权益。这是最便捷、成本最低的解决方式，有助于维护双方的关系和社会的和谐稳定。
二、调解解决
如果协商未能达成一致，您可以考虑请求村民委员会、乡（镇）人民政府等中立第三方进行调解。这些调解机构具备一定的专业知识和调解经验，能够站在中立立场，依据相关法律法规和政策规定，提出合理的调解方案，促使双方达成调解协议。调解协议一旦达成，双方应严格遵守，以确保纠纷的妥善解决。
三、行政处理
若调解无果，您可以向县级以上人民政府土地管理部门提出处理申请。政府会根据实际情况和相关规定，对土地权属纠纷作出行政处理决定。在处理过程中，相关部门会严格依据土地管理法等一系列相关法律法规，全面考量土地的使用历史和实际占有情况等因素，以作出公正合理的处理决定。
四、诉讼解决
如果您对行政处理决定不服，可以在规定期限内向人民法院提起行政诉讼。通过司法途径，由法院依据事实和法律作出公正判决。在诉讼过程中，双方都需要积极提供相关的证据，如土地使用证、承包合同等，以支持自身主张。法院会秉持公正的态度，依据事实和法律进行严谨的判断，最终确定土地的归属以及纠纷的妥善解决。
五、注意事项
保存证据：在处理纠纷过程中，您要注意收集和保存相关证据，如土地承包合同、土地使用证、证人证言等。这些证据将有助于您维护自身合法权益。
遵循法律程序：在处理纠纷时，您必须严格遵循法律程序，不得采取非法手段或暴力行为。否则，可能会承担相应的法律责任。
寻求专业帮助：如果您对法律程序或相关法律法规不熟悉，可以寻求专业律师或法律工作者的帮助。他们能够为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地维护自身权益。
综上所述，对于未确权有争议的承包耕地问题，您可以通过协商、调解、行政处理和诉讼等途径来解决。在处理过程中，请务必遵循法律程序，保存好相关证据，并寻求专业帮助以确保您的合法权益得到妥善维护。