股权拍卖流拍后，申请执行人申请以物抵债的，是否应当具备相关资格或条件，需分情况讨论：
一、一般公司股权
对于一般公司股权的执行，司法解释并未对竞买人资格提出限制要求。在股权拍卖流拍后，若申请执行人愿意接受以物抵债，且该抵债行为符合公司法对于股权转让的要求（如充分保护股东的优先购买权），则法院可以作出以物抵债的裁定。这种情况下，申请执行人无需具备特定的资格或条件。
二、特殊公司股权
对于证券公司、保险公司、保险资产管理公司、商业银行、外资银行、基金管理公司、融资担保公司、期货公司等特殊公司的股权，由于涉及国家产业结构安全、金融秩序或经济秩序稳定，相关法律法规对股权变更设定了行政许可的前置审批程序。因此，在拍卖此类特殊公司股权时，竞买人应当符合相应的资格或条件。
拍卖公告中的资格要求：根据《最高人民法院关于人民法院强制执行股权若干问题的规定》第十五条，人民法院在拍卖特殊公司股权时，应当在拍卖公告中载明法律、行政法规或国务院决定规定的竞买人应当具备的资格或条件。
以物抵债的资格要求：若申请执行人希望以物抵债方式获得特殊公司股权，其自身也必须具备相应的资格或条件。这是因为，以物抵债本质上也是一种股权转让方式，需遵循与拍卖相同的行政许可要求。若申请执行人不具备相关资格，法院不应作出以物抵债的裁定。试图通过“先抵债、再过户至有资质的第三人”的方式规避行政许可，不仅执行效率低下，且极易引发新的执行异议，不应作为特殊公司股权执行的一般规范做法。
实际操作建议：如果申请执行人已经物色到具有符合资质的第三方有承接股权的意愿，完全可通过由该第三方参与竞买的方式竞得股权，从而实现执行目的。这种方式既符合法律法规的要求，又能确保股权变更的顺利进行。
三、法律后果与风险提示
若申请执行人在不具备相关资格或条件的情况下，强行要求以物抵债特殊公司股权，可能面临以下法律后果：
行政许可无法通过：相关部门在审查股权变更资质时，若发现申请执行人不具备相应资格，将不予批准股权变更，导致以物抵债无法实现。
执行异议与纠纷：其他股东或利害关系人可能对以物抵债行为提出执行异议，引发新的法律纠纷。
法律责任承担：若因申请执行人过错导致股权拍卖、变卖、抵债行为无效，相关主体可能需依法承担相应的法律责任。
建议：在处理股权拍卖及以物抵债问题时，务必充分了解并遵守相关法律法规及司法解释的规定。对于特殊公司股权的执行，更应谨慎行事，确保所有操作均符合行政许可要求。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。