在安置补偿协议履行过程中，若发现不合理地方并提起变更诉讼，诉讼时效一般从当事人知道或应当知道权利受到侵害之日起开始计算。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效的起算点
知道或应当知道权利受侵害之日：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在安置补偿协议的情境下，这通常意味着当您发现协议中的某些条款不合理，或者协议的履行方式、标准等与您的预期或法律规定不符，且这种不合理或不符已经对您的权益造成了实际影响时，诉讼时效即开始计算。
特殊情况下的起算点：
- 如果在协议履行过程中，您虽然发现了不合理之处，但当时并未意识到其对您权益的侵害，或者由于某些原因（如对方承诺修改、协商等）而暂时未采取法律行动，那么诉讼时效的起算点可能会推迟到您实际知道或应当知道权利受到侵害，且决定采取法律行动之时。
二、诉讼时效的期间
- 一般情况下，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，从您知道或应当知道权利受到侵害之日起，您有三年的时间来提起诉讼或采取其他法律措施来维护自己的权益。
三、诉讼时效的中断与延长
诉讼时效的中断：
- 在诉讼时效期间内，如果因您向对方提出履行请求、对方同意履行义务、您提起诉讼或申请仲裁等情形，导致诉讼时效期间重新计算，这称为诉讼时效的中断。中断后，诉讼时效期间从最后一次中断事由发生之日起重新计算。
诉讼时效的延长：
- 在某些特殊情况下，如因不可抗力或其他正当理由导致您不能在诉讼时效期间内提起诉讼，人民法院可以根据您的申请决定延长诉讼时效期间。
四、法律建议
及时行动：
- 一旦发现安置补偿协议中的不合理之处，并确认其已对您的权益造成侵害，建议您尽快采取法律行动，以免错过诉讼时效期间。
保留证据：
- 在采取法律行动前，务必收集并保留好相关证据，如协议文本、沟通记录、照片、视频等，以证明您的权益受到了侵害。
咨询专业律师：
- 由于拆迁安置领域的法律问题较为复杂，且涉及您的重大权益，因此建议您在采取法律行动前咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
如果您在安置补偿协议履行过程中遇到了不合理之处，并考虑提起变更诉讼，请务必注意诉讼时效的起算点和期间，及时采取行动并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。