当被执行公司申请破产时，执行程序的处理方式会依据相关法律规定进行。以下是对这一问题的详细解答：

一、执行程序的中止

一旦被执行公司向法院提出破产申请，并且该申请被法院受理，原本正在进行的执行程序将会中止。这是因为破产程序有其特定的流程和规定，需要优先处理公司的债务清偿问题。此时，债权人需要密切关注法院的公告，以便及时了解破产程序的进展。

二、债权的申报与确认

1. 债权申报：在破产程序开始后，债权人需要按照法院的要求及时申报债权。申报时应详细说明债权的数额、有无财产担保等情况，并提交相关证据材料。

2. 债权确认：如果债权人对债权数额或性质存在异议，可以通过诉讼途径解决。管理人（由法院指定）在接管公司财产后，会对债权进行清理、确认，并准备进行后续的变价和分配。

三、债权人会议的参与

债权人可以参加债权人会议，这是破产程序中的一个重要环节。在会议上，债权人可以行使表决权，对破产财产的变价方案、分配方案等事项发表意见。这有助于确保债权人的利益得到充分的考虑和保护。

四、破产清偿与程序恢复

1. 破产清偿：如果公司经审查符合破产条件，法院将宣告其破产，并按照法定顺序清偿债务。这通常包括优先清偿有财产担保的债权、员工工资等，然后才是普通债权的清偿。

2. 程序恢复：如果公司不构成破产条件或者破产程序结束后仍有未清偿的债务，执行程序将会恢复。此时，债权人可以继续通过执行程序来追讨债务。

五、建议与注意事项

1. 密切关注法院公告：债权人应时刻关注法院的公告和通知，以便及时了解破产程序的最新进展。

2. 积极申报债权：债权人应按照规定及时申报债权，并提交充分的证据材料。如果错过申报期限或提交的材料不完整，可能会影响债权的确认和清偿。

3. 参与债权人会议：债权人应积极参加债权人会议，行使自己的表决权，并对破产财产的处理方案发表意见。

4. 配合破产程序：债权人应积极配合破产程序的进行，包括提供必要的资料、参与协商等。这有助于确保破产程序的顺利进行和债权的最大清偿。

综上所述，当被执行公司申请破产时，执行程序将中止，并转入破产程序进行处理。债权人需要密切关注法院公告、及时申报债权、参与债权人会议，并积极配合破产程序的进行。