针对您提出的“房东要借用房产证复印件给租客办理营业执照，怎么合法约定，不愿意迁移或者注销”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确租客要求提供房产证复印件以办理营业执照是合理的，因为这符合市场监督管理部门对企业或个体工商户注册登记时关于经营场所证明文件的要求。然而，作为房东，您在提供房产证复印件的同时，也必须采取一系列措施来保护自身的权益和信息安全。
一、注明用途与留存记录
- 注明用途：
- 在您提供的房产证复印件上，务必用蓝色或黑色圆珠笔清晰注明：“此复印件仅供[租客姓名]办理[公司/个体工商户名称]营业执照使用，再次复印无效；他用无效”。同时，标注日期和您的签名。
- 书写的文字应覆盖在房产证的关键信息上，但确保不遮挡重要内容，如房产证编号、地址等，以确保其仍可用于营业执照办理。
- 留存一份标注用途后的复印件记录，包括提供给租客的时间、租客信息及使用目的等，以备后续查询。
二、签订专项协议
- 协议内容：
- 与租客签订一份关于提供房产证复印件的专项协议，明确使用范围仅限于办理营业执照，不得用于其他任何目的。
- 协议中应包含保密义务条款，要求租客对房产证复印件及上面的信息承担保密责任，不得泄露给第三方。
- 明确违约责任，若租客违反协议约定，如将房产证复印件用于其他目的或泄露信息，将承担相应的法律责任和赔偿责任。
三、确保房产证明的完整性和有效性
个人房产：
- 若房产为您个人所有，需提供有效的房产证复印件，并可附上您的身份证复印件（视具体要求而定）。
公司名下房产：
- 若房产为公司名下，应提供加盖公章的房产证复印件及公司营业执照复印件。
四、租赁合同的明确性
- 合同条款：
- 确保与租客签订了正式的租赁合同，且合同中包含了双方的权利和义务等明确条款。
- 租赁合同应特别注明房产的用途，包括是否允许用于商业经营，以确保与营业执照的办理需求一致。
- 可以在合同中增加一条关于“租客在租赁期间内，如需使用房产证复印件办理营业执照，必须遵守房东的相关规定，并承担由此产生的一切责任”的条款。
五、遵守相关法律法规与行政程序
- 法律要求：
- 根据《中华人民共和国公司法》和《中华人民共和国行政许可法》等相关法律规定，办理营业执照需遵循相关行政程序。
- 房东应确保租客在申请营业执照时，已按照法律要求准备了所有必要的文件和资料，如《公司设立登记申请书》、公司章程、股东会决议等。
六、后续跟进与隐私保护
办理结果确认：
- 在租客办理完营业执照后，房东可要求租客告知办理结果，并确认是否还需保留房产证复印件。
- 若不再需要，应要求租客返还或销毁复印件，以确保信息安全。
隐私保护：
- 在整个过程中，房东应注意保护个人隐私和商业机密，避免泄露不必要的个人详细信息或涉及商业机密的信息。
综上所述，作为房东，在提供房产证复印件给租客办理营业执照时，应通过注明用途、签订协议、确保合同明确性、遵守法律法规以及后续跟进等措施，来平衡租客的合理需求与自身的权益保护，确保信息安全和合规性。希望这些建议能对您有所帮助。