采购人收取投标保证金是合法的，但需遵循一定的规定和限制。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、合法性依据

1. 政府采购法实施条例：根据政府采购法实施条例的相关规定，采购人可根据项目实际需要收取投标保证金。这是采购人收取投标保证金的直接法律依据。

2. 财政部政策文件：财政部也多次通过印发政策文件、举办会议培训等方式，要求各采购单位、采购代理机构规范开展保证金收取事宜，并指导地方财政部门加强监督管理。这进一步确认了采购人收取投标保证金的合法性。

二、收取规定与限制

1. 收取方式：投标保证金应允许以支票、汇票、本票、保函等非现金形式缴纳或提交，不得以任何理由拒绝金融机构、担保机构出具的电子保函。

2. 收取金额：投标保证金不得超过采购项目预算金额的2%。这一限制旨在防止采购人过度收取投标保证金，增加供应商的负担。

3. 退还时限：采购人、代理机构应严格按照相关法律法规要求，自中标通知书发出之日起5个工作日内退还未中标供应商的投标保证金，自政府采购合同签订之日起5个工作日内退还中标供应商的投标保证金，不得延迟退还。

4. 自主选择权：采购人可根据项目特性，在保障政府采购活动正常开展的前提下，自主选择是否收取投标保证金，并鼓励免收或降低收取比例。

三、法律后果与监管

1. 违规行为处理：对于未在规定时限内退还投标保证金等违规行为，财政部门将依法依规严肃处理问责。这包括对采购人、代理机构的罚款、通报批评等措施。

2. 信用体系建设：财政部持续加强政府采购信用体系建设，对供应商的违法失信行为进行惩戒。同时，也要求采购人、代理机构在政府采购活动中查询相关主体的信用记录，以营造公平竞争、诚实守信的政府采购市场环境。

四、实际建议

1. 了解规定：作为供应商，在参与政府采购活动前，应详细了解投标保证金的收取规定与限制，确保自身权益不受损害。

2. 保留证据：在缴纳投标保证金时，供应商应保留好相关证据，如缴纳凭证、退还申请等，以便在发生纠纷时维护自身权益。

3. 及时沟通：若供应商对投标保证金的收取或退还有任何疑问或争议，应及时与采购人或代理机构沟通解决。若无法达成一致意见，可寻求法律途径解决。

如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。