在交通事故案件中，如果法院开庭时被告人缺席，法院通常会按照以下方式处理：
一、缺席判决的可能性
根据《民事诉讼法》的相关规定，如果被告人被传票传唤后，无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭，法院有权进行缺席判决。这意味着，即使被告人没有出庭，法院也会依据原告提供的证据以及相应的法律规定来展开审理，并作出判决。
二、法院审理与判决的过程
证据审查：在审理过程中，法院会仔细审查原告提交的证据，包括但不限于事故现场的照片、交警出具的事故认定报告、医疗费用的相关凭证等。这些证据将作为法院判断事故责任和赔偿金额的重要依据。
法律适用：法院会根据相关法律法规，结合原告提交的证据，对案件进行公正、公平的裁决。如果被告人缺席，法院将基于现有证据和法律规定作出判决。
判决结果：缺席判决并不意味着原告必定胜诉。法院依然会按照事实和法律来进行公平公正的裁决。如果判决结果要求被告人承担赔偿等责任，而被告人不履行，原告可申请强制执行。
三、被告人缺席的法律后果
失去质证与辩论机会：被告人缺席庭审，将失去在法庭上进行陈述、辩解、质证和辩论的机会。这可能导致法院基于原告提交的证据作出对被告人不利的认定。
承担不利判决结果：由于无法有效反驳对方主张和证据，法院可能基于原告的证据和诉求作出对被告人不利的判决。被告人需按判决承担相应责任，如赔偿原告的医疗费、误工费、车辆损失费等损失。
强制执行风险：如果被告人不履行判决，原告可申请强制执行。届时，被告人可能面临财产被查封、扣押、冻结，甚至被限制出境、列入失信被执行人名单等后果，影响其正常生活与信用记录。
四、建议与注意事项
原告准备充分证据：在开庭之前，原告应当充分地准备好各类证据，以支撑自己的诉求。这有助于法院更准确地判断事故责任和赔偿金额。
被告人积极应诉：对于被告人而言，收到传票后应积极应对，按时到庭参加诉讼。如果确实有正当理由无法出庭，应及时向法院申请延期开庭，并说明理由。
上诉权利：如果被告人对判决结果有异议，可以在判决之后通过上诉等方式来维护自己的权益。但需要注意的是，上诉并不意味着一定能改变判决结果，因此应谨慎考虑。
综上所述，交通事故开庭时被告人缺席，法院可能会进行缺席判决。被告人应充分认识到缺席庭审的法律后果，并积极应诉以维护自己的权益。