行政案件在特定情形下是可以做司法确认的。以下是对这一问题的详细分析：

一、行政案件司法确认的法律依据与可行性

根据《中华人民共和国调解法》的相关规定，调解协议在达成后，若双方当事人认为有必要，可以自调解协议生效之日起三十日内共同向人民法院申请司法确认。这一规定明确了行政调解协议可以通过司法途径确认其效力，为调解协议的履行提供了法律保障。因此，行政案件中的调解协议，在符合法定条件的情况下，是可以申请司法确认的。

二、行政案件司法确认的具体情形与流程

1. 具体情形：

   • 行政协议非诉执行案件：如铜陵市郊区法院成功调解的行政协议非诉执行案件，双方就支付费用达成协议后，应双方共同申请，法院对该协议进行了司法确认。
   • 知识产权纠纷行政调解案件：如绵阳市中级人民法院对一起侵害外观设计专利权纠纷案件的行政调解协议进行了司法确认，这是全市首例经过司法确认的知识产权纠纷行政调解案件。

2. 流程：

   • 达成调解协议：行政案件中的双方当事人在行政机关或相关调解组织的主持下达成调解协议。
   • 申请司法确认：双方当事人认为有必要，可以在调解协议生效之日起三十日内共同向人民法院申请司法确认。
   • 法院审查：人民法院在受理司法确认案件申请后，会指定一名审判人员进行审查。审查过程中，对于案情简单的案件，可以采取形式审查的方式；对于案情复杂的案件，人民法院应当通知双方当事人到庭进行询问，采取必要的实质审查和证据调查。
   • 出具裁定书：经审查，调解协议符合法律规定的，人民法院会出具裁定书，确认调解协议的效力。

三、司法确认的法律效力与后果

1. 法律效力：一旦调解协议经过人民法院的司法确认，即具有法律效力。这意味着调解协议对双方当事人具有约束力，双方应当按照调解协议的约定自觉履行义务。
2. 法律后果：若一方当事人拒绝履行或未全部履行调解协议，对方当事人有权向人民法院申请强制执行。这确保了调解协议的有效执行，维护了当事人的合法权益。

四、行政调解无效时的法律救济途径

当行政调解无效时，当事人可以选择向人民法院提起诉讼。根据相关规定，如果经过调解后，双方当事人仍然无法达成调解协议，或者调解协议被人民法院依法确认无效，当事人可以通过人民调解方式变更原调解协议或者达成新的调解协议。如果调解确实无法继续，且双方争议无法得到妥善解决，当事人完全有权向人民法院提起诉讼，通过司法途径解决争议。

总结与建议：

行政案件在特定情形下是可以做司法确认的，这主要适用于行政调解协议。当双方当事人达成调解协议并认为有必要进行司法确认时，可以共同向人民法院申请。经审查符合法律规定的，人民法院会出具裁定书确认调解协议的效力。若一方当事人拒绝履行或未全部履行调解协议，对方当事人有权向人民法院申请强制执行。因此，在处理行政案件时，当事人应充分了解并利用这一法律机制来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。