法定代表人不同但股东相同的情况下，企业是否可以被认定为关联企业，需结合具体情形和相关法律规定进行综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、关联企业的法律定义与认定标准

根据《企业所得税法实施条例》第一百零九条以及《税收征收管理法实施细则》第五十一条的规定，关联企业是指具有下列关系之一的公司、企业和其他经济组织：

1. 资金、经营、购销等方面存在直接或者间接的控制关系；
2. 直接或者间接地同为第三者控制；
3. 在利益上具有相关联的其他关系。

在司法实践中，认定关联企业通常考虑以下因素：

• 股权结构：股东之间的交叉持股、共同投资等情况；
• 控制关系：一方对另一方的经营决策、财务决策等具有实质性影响；
• 业务往来：企业之间是否存在频繁的交易、资金往来等；
• 人员安排：高管、董事等关键人员是否在关联企业之间兼任。

二、法定代表人不同但股东相同的情况分析

1. 股东相同可能构成关联关系：

   • 如果两家企业的股东完全相同，且这些股东对两家企业均具有实质性控制权，那么这两家企业很可能被认定为关联企业。因为股东相同意味着在资金、经营决策等方面可能存在紧密的联系和共同利益。

2. 法定代表人不同不必然排除关联关系：

   • 法定代表人只是企业的法律代表人，负责对外代表企业行使权利、履行义务。法定代表人不同并不意味着企业之间不存在关联关系。关键在于企业之间的实际控制关系、业务往来和利益关联。

3. 需结合其他因素综合判断：

   • 除了股东结构和法定代表人外，还需要考虑企业之间的业务往来、资金流动、人员安排等因素。如果这些因素表明两家企业之间存在实质性的关联关系，那么即使法定代表人不同，也可能被认定为关联企业。

三、实际案例与司法实践

在司法实践中，法院在认定关联企业时，会综合考虑多种因素。例如，如果两家企业虽然法定代表人不同，但股东相同且存在频繁的业务往来和资金流动，那么法院很可能会认定这两家企业为关联企业。反之，如果股东相同但企业之间独立经营、无业务往来和资金流动，那么可能不被认定为关联企业。

四、法律建议与风险提示

1. 完善企业治理结构：

   • 为避免被认定为关联企业而带来的税务、法律等风险，企业应完善治理结构，确保股东、董事、高管等关键人员的安排符合法律法规要求。

2. 加强业务与财务独立性：

   • 企业应保持业务与财务的独立性，避免与关联企业之间存在不合理的交易和资金往来。

3. 及时咨询专业律师：

   • 如果企业涉及复杂的股权结构或关联交易，建议及时咨询专业律师，以确保合规经营并降低法律风险。

总结来看，法定代表人不同但股东相同的情况下，企业是否可以被认定为关联企业需结合具体情形和相关法律规定进行综合判断。如果股东相同且存在实质性的关联关系（如控制关系、业务往来等），那么很可能被认定为关联企业。因此，企业在经营过程中应关注关联关系的认定问题，并采取相应的风险防范措施。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。