针对您提出的“配偶失踪怎么起诉判子女抚养权”的问题，以下是我为您整理的详细解答：

一、确定管辖法院

在配偶失踪的情况下，您通常需要向被告（即失踪的配偶）住所地或经常居住地的基层人民法院提起诉讼。但若被告下落不明或被宣告失踪，您则可以选择向原告（即您自己）住所地或经常居住地的法院提起诉讼。这里需要明确的是，经常居住地指的是公民离开住所地至起诉时已连续居住一年以上的地方（住院就医除外）。

二、准备起诉材料

为了成功起诉并争取子女的抚养权，您需要准备以下起诉材料：

1. 民事起诉状：详细写明原被告的基本信息、您的诉讼请求（即请求法院判决子女抚养权归您）、以及事实与理由（说明对方失踪的情况以及您抚养子女的优势）。

2. 证据材料：

   • 自身经济状况证明：如工作证明、收入流水、房产证等，以证明您有稳定的收入和良好的居住条件。
   • 抚养能力和条件证明：如您的教育背景、健康状况证明等，以体现您教育、照顾子女的能力。
   • 子女生活紧密程度证明：如子女的入学证明、就医记录、日常照片、视频等，以表明子女一直跟随您生活。
   • 对方不适合抚养的证据（如有）：如对方有不良嗜好、无稳定收入等。
   • 对方失踪的证明：如报警记录、社区或村委会的证明、证人证言等，以证明对方失踪的事实。

三、立案审理

1. 提交材料：将准备好的起诉材料一式多份（根据被告人数+1确定份数）提交至有管辖权的人民法院立案庭。

2. 送达与公告：由于被告失踪，法院会采取公告送达方式。公告期一般为60日，期满即视为送达。

3. 开庭审理：公告期满后，法院会安排开庭审理。您需要充分陈述您的诉讼请求和事实理由，并出示相关证据。法院会依据法律规定和现有证据进行审理。

四、判决与执行

1. 判决：法院会根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则作出抚养权归属的判决。

2. 执行：判决生效后，若对方仍处于失踪状态，您可凭判决书办理子女户口迁移等相关手续。若对方出现并对抚养权有异议，您可通过法律程序申请变更。

3. 强制执行：如果对方未履行判决，您可向法院申请强制执行。

五、特殊情况处理

1. 离婚与失踪：若夫妻一方失踪，另一方想离婚，应先向法院申请对方失踪。公告期满后，对方还未出现，法院会宣告其失踪，此时提出离婚，法院会直接判决离婚。

2. 抚养费问题：由于对方失踪无法要求正常支付抚养费，抚养子女的一方可要求法院将失踪方的财物折抵子女抚育费。

六、法律建议

在处理此类问题时，我建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师可以根据您的具体情况，为您提供更详细、更有针对性的法律方案。

总之，在配偶失踪的情况下起诉子女抚养权，需要遵循一定的法律程序和步骤。通过合法程序，法院将依据最有利于子女的原则作出判决。希望以上解答能对您有所帮助。