三方协议盖空头公司的章是无效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律效力的基本原则
根据《民法典》的相关规定，合同（包括三方协议）的成立需要当事人均签名、盖章或者按指印。这里的盖章，应当是真实、有效的印章，代表当事人的真实意思表示。空头公司，即没有实际经营业务或注册信息不实的公司，其印章不具备法律效力，因为它不能代表一个真实存在的法律主体。
二、空头公司印章的法律后果
合同无效：如果三方协议上盖的是空头公司的章，由于该印章不能代表一个有效的法律主体，因此该协议在法律上将被视为无效。这意味着，协议中的权利义务关系对各方均不产生法律约束力。
法律责任：使用空头公司印章签订协议，可能涉嫌欺诈等违法行为。一旦被发现，相关责任人可能需要承担法律责任，包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
三、实际案例与风险提示
在实际操作中，已经发生过因使用空头公司印章签订协议而引发的纠纷。例如，某些不法分子为了骗取财物或逃避法律责任，可能会注册空头公司并伪造印章。一旦与这样的“公司”签订协议，受害方往往难以维护自己的合法权益。
四、建议与措施
核实公司真实性：在签订三方协议前，务必核实公司的真实性和合法性。可以通过查询企业信用信息公示系统、要求对方提供营业执照等文件来验证。
使用有效印章：确保协议上盖的是公司的有效公章或合同专用章。这些印章应当经过工商部门备案，具有法律效力。
咨询专业律师：如果您对协议的法律效力或印章的真实性有疑问，建议及时咨询专业律师。我可以为您提供专业的法律意见和帮助，确保您的合法权益得到保障。
综上所述，三方协议盖空头公司的章是无效的。在签订协议时，请务必核实公司的真实性和印章的有效性，以避免不必要的法律风险和损失。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。