劳务派遣公司在运营过程中，其收入来源主要涉及与用工单位之间的服务费用结算，以及可能从派遣员工薪资管理中的合法扣费（但需注意，直接从员工薪资中扣费作为公司收入是不合规的，以下说明的是合规的收入构成）。具体来说，劳务派遣公司应该拿到的钱主要包括以下几个方面：
一、服务费用
基础服务费：
- 劳务派遣公司根据与用工单位签订的劳务派遣协议，向用工单位收取基础服务费。这笔费用通常涵盖了劳务派遣公司为用工单位提供招聘、筛选、培训、管理派遣员工等服务的成本及合理利润。
管理费：
- 除了基础服务费外，劳务派遣公司还可能根据派遣员工的数量、岗位复杂度、管理难度等因素，向用工单位收取一定的管理费。这笔费用用于覆盖劳务派遣公司在日常管理派遣员工过程中产生的额外成本。
二、社保与公积金代缴服务费（如有）
- 虽然社保和公积金的缴纳主体是用工单位（或实际承担用工成本的主体），但劳务派遣公司可能作为代缴方，为用工单位提供社保和公积金的代缴服务。在此情况下，劳务派遣公司可能会根据代缴服务的复杂性和工作量，向用工单位收取一定的代缴服务费。不过，这通常不是劳务派遣公司的主要收入来源，且具体费用标准需根据双方协议确定。
三、合规的薪资管理相关费用（非直接扣费）
- 劳务派遣公司在代发派遣员工薪资时，会依法依规扣除个人所得税和社会保险费等法定扣费项目。但这些扣费并非劳务派遣公司的收入，而是代为收取并上缴给相关部门的。劳务派遣公司不能从这些扣费中获取任何利益。
- 劳务派遣公司可能因提供薪资计算、发放等增值服务而向用工单位收取一定的服务费用，但这与直接从员工薪资中扣费是截然不同的。
四、其他合规收入
- 劳务派遣公司还可能通过提供其他增值服务（如员工培训、职业规划、法律咨询等）来获取收入。这些服务通常是根据用工单位或派遣员工的需求定制的，并会按照双方协商的价格进行收费。
注意事项
- 劳务派遣公司在运营过程中必须严格遵守相关法律法规，确保所有收入来源合法合规。
- 劳务派遣公司不得直接从派遣员工的薪资中扣费作为公司收入，这是违法的。
- 劳务派遣公司与用工单位之间的服务费用结算应基于双方签订的劳务派遣协议进行，确保费用标准合理、透明。
综上所述，劳务派遣公司的主要收入来源是与用工单位之间的服务费用结算，包括基础服务费、管理费以及可能的社保与公积金代缴服务费（如有）和其他合规收入。