注册为公司的非营运车辆被追尾，是可以申请赔付的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律责任角度
根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照下列规定承担赔偿责任：
- 机动车之间发生交通事故的，由有过错的一方承担赔偿责任；双方都有过错的，按照各自过错的比例分担责任。
- 机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，非机动车驾驶人、行人没有过错的，由机动车一方承担赔偿责任；有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任；机动车一方没有过错的，承担不超过百分之十的赔偿责任。
在您的案例中，如果非营运车辆被追尾，且追尾方存在过错（如未保持安全距离、超速行驶等），那么追尾方应承担相应的赔偿责任。
二、保险赔付角度
- 交强险赔付：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。因此，如果您的车辆购买了交强险，且事故发生在保险期间内，您可以向保险公司申请赔付。
- 商业险赔付：如果您还购买了商业第三者责任险或车辆损失险等商业保险，且事故符合保险条款的赔付条件，您也可以向保险公司申请相应的赔付。
三、实际操作建议
- 及时报警并保留证据：发生交通事故后，应立即报警并保护好现场，同时拍摄照片或视频作为证据。这些证据将有助于后续的事故责任认定和保险赔付。
- 联系保险公司：及时向保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关证明和资料。保险公司将根据事故情况和保险条款进行赔付。
- 协商或诉讼：如果与追尾方就赔偿事宜无法达成一致，您可以考虑通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷。在此过程中，建议您咨询专业律师以获取更全面的法律支持和建议。
总结与建议：注册为公司的非营运车辆被追尾后，您完全有权申请赔付。在处理此类事故时，请务必保持冷静，及时报警并保留证据，同时联系保险公司进行赔付申请。如果遇到纠纷或困难，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律建议和支持。