黄灯时进入待行区并停下，是否会被扣分罚款，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合法进入待行区后遇黄灯停车的情况
若车辆在黄灯亮起前已越过停止线进入待行区：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第三十八条的规定，黄灯亮时，已越过停止线的车辆可以继续通行。这意味着，如果车辆在黄灯亮起前已经越过停止线并进入待行区，那么即使随后黄灯亮起，车辆选择停下来等待也不会因“继续通行”而被扣分或罚款。
- 结论：此种情况下，车辆不会被扣分罚款。
若车辆在黄灯亮起时刚好越过停止线进入待行区并立即停下：
- 如果车辆在黄灯亮起时刚好越过停止线，但能够立即停住并且没有继续向前移动，这种行为一般也不会被认定为闯红灯或违反交通规则，因此不会受到处罚。
- 结论：此种情况下，车辆同样不会被扣分罚款。
二、可能扣分罚款的情况
红灯时进入待行区：
- 如果车辆是在直行信号灯为红灯时擅自闯入待行区，这明显违反了交通规则，属于违章行为。
- 结论：对于此类行为，交通管理部门可能会根据具体情况作出相应的判定，并对驾驶员进行扣分罚款。
待行区内违法停车影响交通：
- 虽然车辆在合法进入待行区后遇黄灯停车等待通常不会扣分，但如果停车时间过长，影响了其他车道的正常通行，或者违反了待行区内明确的交通标志、标线禁止停车的规定，也可能被认定为违法行为而受到处罚。
- 结论：此种情况下，车辆可能会因违法停车而受到扣分罚款。
三、安全驾驶与合规行驶的建议
- 密切关注交通信号灯：驾驶员在驾驶过程中应密切关注交通信号灯的变化，确保在黄灯亮起前或亮起时做出正确的驾驶决策。
- 遵守交通规则：严格遵守交通规则，不闯红灯、不违法停车，确保行车安全。
- 谨慎判断与合规行驶：在遇到黄灯时，应谨慎判断是否可以继续通行或需要停车等待。如果无法确定是否可以进入待行区或继续通行，最好选择停车等待下一个绿灯再行通过。
总结：黄灯时进入待行区并停下是否会被扣分罚款，取决于车辆进入待行区的具体时机、方式以及是否遵守了交通规则。为了遵守法律法规并确保行车安全，建议驾驶员在实际驾驶过程中密切关注交通信号灯的变化和当地的交通管理规定，谨慎判断、合规行驶。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。