结论：烟管非法经营案件中，普通员工取保候审后移交检察院，并不意味着必须移交法院；普通员工是否会被判刑，需根据其在案件中的具体作用、主观明知程度及参与程度等因素综合判断。
一、关于取保候审后案件的移交流程
取保候审的性质：
- 取保候审是刑事诉讼中的一种强制措施，旨在保证犯罪嫌疑人、被告人不逃避或妨碍侦查、起诉和审判，并随传随到。它并不意味着案件的终结或犯罪嫌疑人、被告人的无罪。
案件移交流程：
- 在烟管非法经营案件中，普通员工取保候审后，案件会继续由公安机关进行侦查。侦查终结后，公安机关会将案件移送检察院审查起诉。
- 检察院在审查起诉阶段，会对案件进行全面审查，包括证据的合法性、充分性以及犯罪嫌疑人的刑事责任等。如果检察院认为案件事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任，就会将案件移送法院提起公诉。
- 但并非所有案件都会移送法院。如果检察院在审查起诉阶段发现案件证据不足、事实不清或犯罪嫌疑人情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的，可以作出不起诉决定，此时案件就不会移送法院。
二、关于普通员工是否会被判刑
刑事责任的判断标准：
- 在烟管非法经营案件中，普通员工是否会被判刑，主要取决于其在案件中的具体作用、主观明知程度及参与程度等因素。
- 如果普通员工明知是非法经营行为而参与，且在案件中起到了重要作用（如组织、策划、实施等），那么其很可能被追究刑事责任。
- 如果普通员工对非法经营行为并不知情，或者虽然知情但并未参与实施，那么其可能不会被追究刑事责任。
量刑情节的考虑：
- 即使普通员工被认定有罪，法院在量刑时也会考虑其犯罪情节、悔罪表现、社会危害程度等因素。
- 对于情节轻微、悔罪表现好的犯罪嫌疑人，法院可能会判处较轻的刑罚或适用缓刑等非监禁刑。
三、建议与注意事项
积极配合调查：
- 如果普通员工被取保候审，应积极配合公安机关、检察院的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
寻求法律帮助：
- 在案件处理过程中，普通员工可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自己的合法权益。
关注案件进展：
- 普通员工应关注案件的进展情况，及时了解自己的法律地位和可能面临的法律后果。
如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供全面的法律建议和辩护策略。