结论前置：哥哥单方面确权宅基地的行为，在多数情况下是不合法的。宅基地的确权需要遵循法定程序，并确保所有合法继承人的权益得到保障。

1. 宅基地确权的法定程序

宅基地的确权并非由个人单方面决定，而是需要遵循一定的法定程序。这通常包括提交相关证明材料、经过村集体经济组织或村民委员会的审核、公示以及最终由相关部门颁发确权证书等步骤。在这个过程中，所有合法继承人的权益都应当得到充分的考虑和保障。

2. 女儿作为合法继承人的权益

在父母去世后，其留下的宅基地应作为遗产进行分配。根据《民法典》的相关规定，女儿和哥哥作为第一顺序继承人，享有平等的继承权。这意味着，女儿也有权参与宅基地的确权过程，并对其份额提出主张。因此，哥哥单方面确权宅基地，忽视了女儿的合法权益，是不合法的。

3. 哥哥单方面确权的法律后果

如果哥哥未经女儿同意，单方面进行了宅基地的确权，这可能会引发一系列的法律后果。首先，女儿有权向相关部门提出异议，要求撤销或更正确权证书。其次，如果因此产生了纠纷，女儿还可以通过法律途径来维护自己的权益，如提起民事诉讼等。在诉讼过程中，法院将会根据事实和法律规定，对宅基地的归属进行裁决。

4. 建议与措施

• 沟通协商：首先，建议女儿和哥哥进行沟通协商，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。这可以包括对宅基地的共同使用、分割或出售等。
• 寻求法律援助：如果沟通协商无果，女儿可以寻求专业的法律援助，了解自己的权益和可行的法律途径。
• 提起民事诉讼：在必要时，女儿可以向法院提起民事诉讼，要求确认自己的继承权并分割宅基地。

5. 特殊情况下的考虑

虽然女儿和哥哥作为第一顺序继承人享有平等的继承权，但在某些特殊情况下，如女儿已经放弃继承权或存在其他法定继承情形时，宅基地的确权可能会有所不同。然而，在这些特殊情况下，也需要遵循法定程序，并确保所有相关方的权益得到妥善处理。

综上所述，哥哥单方面确权宅基地的行为在多数情况下是不合法的。女儿作为合法继承人，有权参与宅基地的确权过程并维护自己的权益。如果遇到相关问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。