贪污罪中，公司运营成本通常不会被算作犯罪成本。以下是对此问题的详细分析：

一、贪污罪的犯罪构成

贪污罪是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。其犯罪构成主要包括四个方面：

1. 主体要件：必须是国家工作人员，包括在国家机关中从事公务的人员，以及国有公司、企业、事业单位、人民团体中从事公务的人员等。
2. 主观要件：必须具有非法占有公共财物的故意。
3. 客体要件：侵犯的是公共财物的所有权。
4. 客观要件：表现为利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。

二、公司运营成本与贪污罪的关系

公司运营成本是公司为了维持正常运营而发生的各项费用，如员工工资、租金、水电费等。这些费用是公司正常经营活动的必要支出，与贪污罪中的“非法占有公共财物”行为有本质区别。

1. 性质不同：公司运营成本是合法的经营支出，而贪污罪中的财物是非法的占有对象。
2. 目的不同：公司运营成本的支出是为了公司的正常运营和发展，而贪污罪的目的是为了非法占有公共财物。
3. 法律后果不同：公司运营成本的支出受法律保护，而贪污罪则要受到法律的制裁。

三、犯罪成本的界定

在刑法中，犯罪成本通常指的是犯罪分子为了实施犯罪而投入的各种资源，如时间、金钱、精力等。然而，这些成本并不包括合法的经营支出或正常的业务活动费用。在贪污罪中，犯罪成本主要指的是犯罪分子为了非法占有公共财物而采取的手段或付出的代价，如伪造文件、行贿等，而不包括公司正常的运营成本。

四、司法实践中的处理

在司法实践中，法院在审理贪污罪案件时，会严格区分合法的经营支出与非法的占有行为。公司运营成本作为合法的经营支出，不会被计入贪污罪的犯罪数额中。法院会依据贪污罪的犯罪构成要件，对犯罪分子的非法占有行为进行认定和处罚。

总结与建议：

贪污罪中，公司运营成本不会被算作犯罪成本。这是因为公司运营成本是合法的经营支出，与贪污罪中的非法占有行为有本质区别。如果你或你身边的人涉及贪污罪的相关问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。