在处理涉及孩子非亲生的案件时，法院的判决会依据一系列法律原则和具体案情来综合考量，以确保公平、合理地保障各方合法权益。以下是对此类案件判决的详细分析：
一、亲子关系的确认
首先，法院会通过合法的亲子鉴定程序来明确孩子与非亲生父亲之间的关系。这是后续所有法律处理的基础。一旦鉴定结果确认孩子非亲生，法院将明确判决亲子关系不存在。
二、婚姻关系的处理
离婚判决：
- 若因一方在婚姻期间与他人发生性关系导致孩子非亲生，且夫妻感情确已破裂，无过错方有权请求离婚。法院在审理此类案件时，会综合考虑双方感情状况、过错程度等因素，判断是否准予离婚。
- 若被告坚决不同意离婚，并能证明夫妻间仍有感情基础，法院可能会综合考虑后决定是否在第一次起诉时判决离婚。但通常情况下，若证据充分，法院会倾向于准予离婚。
损害赔偿责任：
- 无过错方因对方的行为遭受精神和经济上的双重损害，有权要求对方承担损害赔偿责任。法院将根据过错方的过错程度、无过错方的受伤害程度等因素，酌情判定赔偿数额。
三、财产分割与费用返还
离婚财产分割：
- 在夫妻共同财产分割中，法院会倾向于保护无过错方，适当多分夫妻共同财产。具体比例需根据案件实际情况确定，如双方的贡献、经济状况等。
- 无过错方为抚养非亲生子女所支出的抚养费、教育费、医疗费等，法院会判决有过错方予以返还。返还金额将结合实际支出和相关证据来确定。
非婚姻关系中的费用返还：
- 若不存在婚姻关系，一方误以为孩子是亲生而抚养，后发现非亲生，该方无继续抚养的法律义务。对于已支付的抚养费用，法院同样会判决亲生父母予以返还，并可能根据实际情况判决亲生父母给予适当补偿。
四、子女抚养问题
抚养权归属：
- 孩子抚养权通常判给亲生父母中的一方。法院会从有利于孩子成长的角度出发，综合考虑双方的抚养能力、抚养条件、孩子的意愿（如达到一定年龄）等因素，确定最适宜的抚养安排。
- 在特定情况下，如非亲生父亲愿意承担抚养责任且具备抚养条件，虽无血缘关系，但也可能获得抚养权。不过，这种情况较为罕见，需要法院综合评估后作出决定。
抚养费承担：
- 非亲生父亲与孩子无亲子关系，无需再承担抚养义务。已支付的抚养费可根据具体情况要求返还部分或全部。
- 抚养费用应由与孩子有亲生关系的父母一方自行承担。若亲生父母无法承担或拒绝承担，法院可能会根据实际情况作出相应判决。
五、精神损害赔偿
孩子非亲生对无过错方的精神造成严重伤害，符合《民法典》中关于精神损害赔偿的情形。法院将综合考虑过错方的过错程度、无过错方的精神痛苦程度、当地生活水平等因素，酌情判定有过错方给予无过错方一定数额的精神损害抚慰金。
结论与建议
综上所述，法院在处理孩子非亲生的亲子关系纠纷案件时，会严格依据事实和相关法律法规进行判决。判决结果会因案件的具体细节而有所不同，包括亲子关系确认、婚姻关系处理、财产分割、费用返还、抚养权与抚养费以及精神损害赔偿等多个方面。
建议：如遇类似问题，建议及时咨询专业律师，以便更有效地维护自己的合法权益。律师可以根据具体案情提供针对性的法律建议，帮助当事人更好地应对法律纠纷。