结论前置：在破产清算中发现法人犯罪时，股东的处理需根据其是否参与犯罪、是否尽到忠实勤勉义务等情形综合判断，具体分为以下几种情况：

1. 股东未参与法人犯罪且无过错

• 责任范围：若股东未参与法人犯罪行为，且已履行股东基本义务（如足额出资、不干预公司违法经营），则一般不承担刑事责任或连带民事责任。
• 法律依据：根据《公司法》第20条，股东滥用权利逃避债务需承担连带责任，但未参与犯罪的股东不适用此条款。
• 实务建议：股东应保留出资证明、未参与经营决策的证据（如股东会决议记录），避免被误认为共犯。

2. 股东参与法人犯罪或存在重大过错

• 刑事责任：若股东直接参与犯罪（如伪造账目、抽逃出资），可能构成共同犯罪，需承担《刑法》中相应罪名（如妨害清算罪、隐匿/故意销毁会计凭证罪）的刑事责任。
• 民事责任：根据《企业破产法》第125条，董事、监事或高管因违反忠实勤勉义务导致破产的，需承担民事赔偿责任；股东若同时担任高管且有过错，亦可能被追责。
• 实务建议：股东需立即停止违法行为，主动配合清算组调查，争取从轻处理；若已涉及刑事程序，建议尽快委托律师介入。

3. 股东未履行出资义务或抽逃出资

• 民事责任：根据《公司法》第28条及《企业破产法》第35条，股东未履行或未全面履行出资义务的，管理人有权要求其补缴出资；抽逃出资的股东需返还资金，并可能被罚款。
• 刑事责任：若抽逃出资数额巨大、后果严重，可能构成《刑法》第159条的抽逃出资罪（适用于实缴制公司）。
• 实务建议：股东应尽快补足出资或返还抽逃资金，减少对破产程序的影响；若已进入刑事程序，需积极退赃以争取从宽处理。

4. 股东作为清算义务人未履行职责

• 责任范围：根据《公司法》第183条及《企业破产法》第125条，有限责任公司的股东若为清算义务人，未及时清算导致公司财产贬值、流失或毁损的，需在造成损失范围内承担赔偿责任。
• 实务建议：股东应督促管理层及时启动清算程序，保留清算过程文件（如清算报告、资产评估报告），避免因程序瑕疵被追责。

总结：破产清算中发现法人犯罪时，股东的处理需结合其具体行为、过错程度及法律身份综合判断。建议股东在遇到此类问题时，及时整理相关证据（如出资记录、会议决议、财务凭证等），并向我详细说明情况，以便制定针对性应对方案。