执行由他人代持的股权，核心在于通过合法程序将名义股东持有的股权变更或实际控制至实际出资人名下，或通过法律手段实现权益。具体执行方式需结合代持协议的效力、公司章程规定及实际出资情况综合判断。以下是具体分析：

1. 优先依据代持协议主张权利

• 协议有效性是前提：若代持协议（如《股权代持协议》）系双方真实意思表示，不违反法律强制性规定（如非金融类公司代持一般有效），实际出资人可依据协议要求名义股东配合办理股权变更登记。
• 操作路径：
  1. 协商变更：与名义股东协商，签署股权转让协议，并通知公司及其他股东（若公司章程要求优先购买权）。
  2. 强制执行：若名义股东拒不配合，可向法院起诉要求确认股权归属并强制过户，同时申请财产保全冻结股权。

2. 无协议或协议无效时的处理

• 实际出资证明：若无书面协议，需通过银行转账记录、公司分红记录、股东会决议等证据证明实际出资关系。
• 公司章程与股东名册：若公司章程或股东名册已登记名义股东，需先通过公司内部程序（如股东会决议）确认实际出资人身份，再办理变更。
• 隐名股东显名化：根据《公司法司法解释（三）》第24条，实际出资人需经公司其他股东半数以上同意，方可请求公司变更股东、签发出资证明书等。

3. 名义股东擅自处分股权的风险应对

• 第三人善意取得：若名义股东将股权转让给第三人，且第三人符合善意取得条件（如合理价格、已办理变更登记），实际出资人可能丧失股权，但可向名义股东主张赔偿。
• 预防措施：在代持协议中约定名义股东不得擅自处分股权，并要求其将股权质押给实际出资人以增强约束力。

4. 公司破产或清算时的权益保护

• 实际出资人地位：若公司进入破产程序，实际出资人一般不能直接以股东身份主张权利，但可依据代持协议向名义股东追偿损失。
• 例外情形：若能证明代持行为被公司或其他股东明知且认可，可能突破合同相对性，直接向公司主张权利（需具体证据支持）。

5. 税务与合规风险

• 股权变更税务：股权过户需缴纳印花税，若涉及溢价转让，还可能产生个人所得税或企业所得税。
• 合规建议：操作前咨询税务机关，确保流程符合《税收征收管理法》及股权转让税务规定，避免因程序瑕疵导致税务处罚。

行动建议：

1. 立即梳理代持协议、出资凭证等证据；
   
2. 与名义股东协商，优先通过和平方式解决；
   
3. 若协商无果，尽快委托律师起诉确认股权归属并申请强制执行；
   
4. 同步与公司沟通，确保变更程序符合公司章程及《公司法》要求。
   

如有进一步细节（如代持协议内容、公司类型等），可提供具体信息以便针对性分析。