股权由他人代持在我国法律框架下是合法的，但需满足一定条件和遵循相关法律规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、股权代持的合法性基础
《中华人民共和国公司法》及相关司法解释：
- 《公司法》并未直接禁止股权代持行为。虽然《公司法司法解释（三）》对股权代持协议的法律效力进行了规定，但并未否定股权代持本身的合法性。
- 有限责任公司股东资格的取得以公司章程记载和工商登记为准，但这并不妨碍实际出资人与名义股东之间通过协议约定股权归属。
- 《公司法司法解释（三）》第二十四条明确规定，有限责任公司的实际出资人与名义出资人订立合同，约定由实际出资人出资并享有投资权益，以名义出资人为名义股东，如无法律规定的无效情形，人民法院应当认定该合同有效。
《中华人民共和国民法典》：
- 根据《民法典》的相关规定，股权代持作为一种委托代理行为，其合法性得到法律承认。只要实际出资人与名义股东之间签订的股权代持协议不存在法律规定的无效情形，如欺诈、胁迫、恶意串通等，该协议即为有效，代持行为也受到法律保护。
二、股权代持的合法性条件
协议内容合法：
- 股权代持协议的内容不得违反法律法规的强制性规定，如不得涉及非法集资、洗钱等违法犯罪活动。
双方意思表示真实：
- 实际出资人和名义股东在签订股权代持协议时，必须出于真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
不违反公序良俗：
履行相关手续：
- 虽然股权代持协议本身不需要办理特别的审批或登记手续，但在实际操作中，为了保障双方的权益，建议办理相关的公证或见证手续。同时，在公司内部，可能需要按照公司章程的规定进行股权转让或增资等程序。
三、股权代持的特殊情形与限制
特定行业限制：
- 在金融、证券等特定行业，对股份代持有更严格的规定和监管要求。例如，某些金融监管政策可能禁止金融机构存在股份代持情形。在这些行业进行代持时，需特别注意遵守相关法规，以避免无效或面临监管处罚。
上市公司限制：
- 鉴于上市公司信息披露的重要性，证券监管部门对上市公司股权代持持否定态度，以维护证券市场秩序和投资者利益。因此，在上市公司中，股权代持行为可能面临更大的法律风险和监管挑战。
四、股权代持的法律风险与防范
名义股东擅自处分股权：
- 名义股东擅自转让股权属于无权处分行为，实际出资人应确保代持协议的严密性以防止此类风险。例如，可以在代持协议中明确约定名义股东不得擅自处分股权，否则应承担相应的违约责任。
实际出资人权利保护：
- 实际出资人在行使股东权利时可能面临诸多挑战，如难以显名、难以参与公司决策等。因此，应强化代持协议的法律效力，并在必要时采取法律手段维权。例如，实际出资人可以通过与名义股东签订详细的代持协议，明确双方的权利和义务，以及在公司治理中的角色和地位。
税务风险规划：
- 股权代持可能涉及税务问题，如个人所得税、企业所得税等。双方应咨询专业税务机构，确保税务合规。例如，可以在代持协议中明确约定税务责任的承担方式，以避免未来因税务问题产生纠纷。
举例说明：假设甲是某公司的实际出资人，但由于某些原因无法直接成为公司股东，于是与乙签订股权代持协议，约定由乙作为名义股东代持甲的股权。在这种情况下，只要股权代持协议的内容合法、双方意思表示真实、不违反公序良俗，并且履行了相关手续（如公证或见证），那么该股权代持行为就是合法的。然而，如果甲和乙在代持协议中约定了违反法律法规的条款，或者乙擅自处分了甲的股权，那么该股权代持行为就可能面临法律风险。
总结与建议：股权由他人代持在符合相关法律法规及监管要求的前提下是合法的。然而，由于股权代持涉及复杂的法律关系和潜在的法律风险，因此在实际操作中应谨慎对待。如果您有股权代持的需求或疑问，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。