结论：撞狗后逃逸但后来主动处理，保险公司是否拒赔需分情况讨论，主要取决于保险条款约定、事故性质及逃逸行为的法律定性。以下是具体分析：

1. 保险条款中“逃逸”的免责约定

• 商业车险（如交强险、第三者责任险）通常将“事故发生后，被保险人或驾驶人未依法采取措施的情况下驾驶保险车辆或者遗弃保险车辆逃离事故现场”列为免责情形。
  
• 关键点：若保险条款明确将“逃逸”定义为免责事由（无论是否主动处理），且逃逸行为被交警认定（如事故认定书载明），保险公司可能拒赔。
  
• 例外：若逃逸后主动投案、配合调查，且保险公司未在条款中明确“主动处理可免除拒赔”，仍可能被拒赔，需结合其他因素判断。

2. 逃逸行为的法律定性

• 根据《道路交通安全法》第99条，造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，处200-2000元罚款，可并处15日以下拘留。
  
• 若逃逸被行政处罚：保险公司可能以“违反法律强制性规定”为由拒赔，即使后续主动处理，仍可能被认定为“未依法采取措施”。
  
• 若逃逸未被认定：如事故认定书未载明逃逸，或仅因“未及时报警”但无逃避责任主观故意，保险公司可能无法以“逃逸”为由拒赔。

3. 主动处理对理赔的影响

• 积极效果：主动投案、配合调查、赔偿损失，可能减轻保险公司对“恶意逃逸”的认定，但无法直接推翻保险条款中的免责约定。
  
• 局限性：若保险条款明确“逃逸即免责”，主动处理可能仅影响量刑（如行政处罚减轻），但无法改变保险合同效力。

4. 实务建议

• 第一步：立即联系保险公司，说明情况并提交事故认定书、处理记录等材料，争取协商理赔。
  
• 第二步：若拒赔，可要求保险公司出具书面拒赔通知，并核对保险条款是否明确“逃逸免责”。
  
• 第三步：若对拒赔有异议，可向当地银保监会投诉或通过诉讼解决，需重点证明“逃逸行为未导致损失扩大”或“保险公司未尽到提示说明义务”。

总结：保险公司是否拒赔需结合保险条款、事故认定及逃逸行为的法律后果综合判断。建议尽快整理相关材料，与保险公司沟通，必要时通过法律途径维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。