结论前置：客运车肇事后被认定为主要责任，交警会依法进行事故责任认定、采取行政强制措施（如扣车）、对违法行为进行处罚，并可能组织调解；若调解不成，当事人可向法院起诉。以下是具体处理流程：

1. 事故责任认定

• 交警会依据《道路交通安全法》及实施条例，通过现场勘查、调查取证（如监控、证人证言）、车辆技术鉴定等，确定事故责任比例。
• 若客运车被认定为主要责任，意味着其违法行为（如超速、超载、疲劳驾驶、违规变道等）是导致事故的主要原因。
• 责任认定书会明确双方责任比例（如主责70%、次责30%），并作为后续赔偿、处罚的依据。

2. 行政强制措施

• 交警可依法扣留肇事车辆（如需检验鉴定），但需在3日内出具书面凭证，并在检验鉴定后5日内通知当事人领取车辆。
• 若客运车存在严重违法行为（如酒驾、毒驾），交警可能对驾驶员采取行政拘留等强制措施。

3. 违法行为处罚

• 根据《道路交通安全法》，客运车驾驶员可能面临以下处罚：
  • 罚款：如超速、超载、违规停车等，罚款金额从200元至2000元不等。
  • 记分：一次记12分（如酒驾、逃逸）、6分（如超速50%以上）等，记满12分需参加学习并考试。
  • 吊销驾照：如酒驾、肇事逃逸构成犯罪，将吊销驾照且5年内不得重考。
  • 刑事责任：若事故造成严重后果（如死亡、重伤），可能涉嫌交通肇事罪，需承担刑事责任。

4. 损害赔偿调解

• 交警可组织双方调解，依据责任认定书确定赔偿金额（如医疗费、误工费、车辆损失等）。
• 若调解成功，双方签署调解协议；若调解不成，当事人可向法院提起民事诉讼。

5. 后续法律程序

• 民事诉讼：受害人可起诉客运公司及驾驶员，要求赔偿损失（包括死亡赔偿金、残疾赔偿金等）。
• 刑事诉讼：若构成交通肇事罪，检察院将提起公诉，法院将依法判决。

6. 客运公司的连带责任

• 根据《民法典》第1211条，若驾驶员因执行工作任务造成他人损害，用人单位（客运公司）需承担侵权责任。
• 客运公司若未尽到安全管理义务（如未定期检修车辆、未培训驾驶员），可能面临行政处罚或民事赔偿。

温馨提示：若您或家人涉及此类事故，建议保留医疗票据、事故现场照片等证据，并及时咨询我以维护合法权益。