《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉有关担保制度的解释》第二十一条主要涉及了担保纠纷案件的主管和管辖问题，以下是对该条文的详细解读：
一、仲裁条款的效力与法院管辖
仲裁条款的独立效力：
- 若主合同或担保合同中明确约定了仲裁条款，则相关合同当事人之间的纠纷应通过仲裁方式解决，人民法院对此类纠纷无管辖权。这体现了仲裁协议排除法院管辖的原则，确保了仲裁的独立性和有效性。
一并起诉债务人和担保人时的管辖：
- 当债权人选择一并起诉债务人和担保人时，应根据主合同来确定管辖法院。这是因为主合同是基础法律关系，债务人和担保人之间的权利义务关系通常围绕主合同展开。以主合同确定管辖，有助于保证纠纷在一个统一的管辖框架下处理，便于查明案件事实，提高诉讼效率。
二、单独起诉担保人时的管辖
- 在债权人依法可以单独起诉担保人且仅起诉担保人的情况下，应根据担保合同来确定管辖法院。这体现了对当事人在担保合同中关于管辖约定的尊重，因为此时的争议主要集中在担保合同所涉及的权利义务上。通过根据担保合同确定管辖，可以更准确地解决纠纷，保护当事人的合法权益。
三、具体应用场景与注意事项
主合同有仲裁条款，担保合同无仲裁条款：
- 在此情况下，法院对主合同债权债务关系无管辖权，但对担保合同纠纷具有管辖权。因为担保合同虽是从债务，但担保法律关系与主债权债务关系是相互独立的。
主合同无仲裁条款，担保合同有仲裁条款：
- 此时，法院对主合同纠纷具有管辖权，但对担保合同纠纷无管辖权。债权人若想通过仲裁解决担保合同纠纷，需依据担保合同中的仲裁条款向仲裁机构申请仲裁。
补充协议与主合同仲裁条款的关系：
- 补充协议是否适用主合同的仲裁条款，需看是否构成独立的法律关系。若补充协议与主合同紧密相关，且未对争议解决方式作出新的约定，则可能适用主合同的仲裁条款。但若补充协议构成了独立的法律关系，且对争议解决方式有新的约定，则应按照补充协议的约定来确定管辖。
四、法律建议
- 明确约定争议解决方式：在签订主合同和担保合同时，应明确约定争议解决方式，包括仲裁或诉讼等。这有助于在纠纷发生时，快速、有效地解决争议，降低诉讼成本。
- 注意合同独立性：虽然担保合同是从合同，但担保法律关系与主债权债务关系是相互独立的。因此，在约定争议解决方式时，应分别考虑主合同和担保合同的约定，避免产生管辖争议。
- 及时咨询专业律师：在涉及担保纠纷案件时，建议及时咨询专业律师，了解相关法律规定和诉讼程序，以便更好地维护自己的合法权益。
如有任何关于担保纠纷案件的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供全面、准确的法律建议。