用政府文件作为法律依据时，确实需要进行合法性审查。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、合法性审查的必要性
保障公民权利：政府文件往往涉及公民、法人或其他组织的权利义务。如果文件内容不合法，可能会侵犯公民的合法权益。例如，一份关于城市管理的政府文件如果违反了上位法，可能会对市民的行为进行不合理的限制，从而侵犯其自由权。因此，对政府文件进行合法性审查，是保障公民权利不受侵害的重要手段。
维护法治统一：政府文件必须与上位法保持一致，以维护国家法律体系的一致性和权威性。如果政府文件与上位法相抵触，将会破坏法治的统一，导致法律适用的混乱。合法性审查可以确保政府文件在制定过程中遵循法定程序和权限，不与上位法相冲突。
促进依法行政：政府文件是行政机关行使职权、履行职责的重要依据。对政府文件进行合法性审查，可以促使行政机关在制定和执行文件时遵循法定程序和权限，提高行政行为的合法性和规范性。这有助于防止行政机关滥用职权、越权行事，从而维护政府的公信力和形象。
二、需要合法性审查的政府文件类型
行政规范性文件：这类文件具有普遍约束力，可以反复适用。例如，某市政府为了加强城市环境卫生管理而制定的《XX市城市环境卫生管理办法》。这类文件直接规范了市民的行为和城市管理的标准，因此必须进行合法性审查。
重大行政决策相关文件：这类文件涉及本地区经济社会发展全局、社会涉及面广、与人民群众利益密切相关。例如，某县政府关于在本县范围内开展大规模旧城改造项目的决策方案及相关配套文件。由于这类决策往往会对当地的经济、社会和人民生活产生深远影响，因此必须确保其合法性。
行政处罚决定书和行政许可决定书：这两类文件直接关系到当事人的财产权益、经营资格等重要权利。例如，市场监管部门对一家违规经营的企业作出的罚款处罚决定书，或者建设部门颁发的建筑工程施工许可证。合法性审查可以确保这些文件的制定和执行符合法律规定，防止滥用职权和不当处罚。
三、合法性审查的具体流程
形式审查：主要审查政府文件的制定程序是否合法，包括是否经过法定程序审议、是否公开征求意见等。
实质审查：主要审查政府文件的内容是否合法，包括是否与上位法相抵触、是否侵犯公民合法权益等。
反馈与修正：如果发现政府文件存在合法性问题，应当及时向制定机关反馈，并要求其进行修正。
四、法律后果
如果政府文件未经合法性审查或者审查不通过而作为法律依据使用，可能会导致以下法律后果：
行政行为无效：如果政府文件作为行政行为的依据而未经合法性审查，该行政行为可能会被认定为无效。
行政机关承担责任：如果因政府文件不合法而导致公民、法人或其他组织遭受损失，行政机关可能需要承担相应的赔偿责任。
影响政府公信力：政府文件不合法会损害政府的公信力和形象，降低公众对政府的信任度。
建议：在实际操作中，无论是行政机关还是公民、法人或其他组织，在使用政府文件作为法律依据时，都应当确保该文件已经经过了合法性审查。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。