已退休官员因职务犯罪被留置期间，不一定会调查他与曾经的下属的不正当男女关系，除非这种关系与案件有关。以下是对此问题的详细分析：

一. 留置期间的调查重点

1. 监察机关的调查重点：根据《中华人民共和国监察法》的相关规定，监察机关在留置期间主要关注的是被调查人的职务违法行为或职务犯罪行为，以及与之相关的证据和事实。
2. 男女关系通常不属于调查重点：男女关系通常属于个人隐私范畴，并不直接作为监察机关调查的重点。

二. 不正当男女关系与案件关联性的考量

1. 关联性的界定：如果男女关系涉及到权钱交易、利益输送等违法行为，或者与被调查人的职务行为存在关联，那么监察机关在调查过程中可能会对此进行必要的了解和审查。
2. 实例说明：例如，如果已退休官员利用职权为曾经的下属谋取不正当利益，而这种利益输送与双方的不正当男女关系存在某种形式的关联，那么监察机关在调查过程中可能会对这种关系进行调查。

三. 监察机关的调查程序与原则

1. 依法调查：监察机关在调查过程中会严格遵循法定程序，确保调查的合法性和正当性。
2. 权益保障：根据《中华人民共和国监察法》第四十四条的规定，对被留置人员的权益也给予了相应的保障，包括通知家属、保障饮食休息和安全、提供医疗服务等。

四. 结论与建议

1. 结论：已退休官员因职务犯罪被留置期间，不一定会调查他与曾经的下属的不正当男女关系，这取决于这种关系是否与案件有关。
2. 建议：对于涉及职务犯罪的案件，监察机关的调查是全面而深入的。如果已退休官员或其家属对留置期间的调查范围有疑问，建议通过合法途径向监察机关提出，并积极配合调查工作。

我的观点是，监察机关在留置期间的调查是严格依法进行的，旨在查清被调查人的职务违法行为或职务犯罪行为。对于不正当男女关系等个人隐私问题，除非与案件有直接关联，否则通常不会成为调查的重点。如有进一步需要，您可以继续咨询我。