针对您提出的事业单位长期借款超过20年如何处理的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

首先，我们需要明确的是，借款时间超过20年，在法律上确实涉及到了诉讼时效的问题。根据我国现行法律规定，最长诉讼时效为20年。这意味着，如果从借款发生之日起已经超过了20年，并且在这期间没有发生诉讼时效中断等法定事由，那么债务人可能会享有诉讼时效抗辩权。

接下来，我们根据具体情况来分析如何处理：

1. 查看借款合同：

   • 首先，要仔细查看借款合同中是否明确约定了还款期限。
   • 如果合同中约定了还款期限，那么需要判断债权人在这20年间是否曾向债务人（即事业单位）主张过权利。如果存在有效主张权利的情形，诉讼时效会中断，并从中断时起重新计算。

2. 未约定还款期限的情况：

   • 如果借款合同中未约定还款期限，那么债权人可以随时要求债务人还款，但需要给债务人一定的合理准备时间。
   • 在这种情况下，同样需要考虑是否已过最长诉讼时效。如果从借款发生之日起已达20年，且不存在诉讼时效中断等法定事由，债务人可能会享有诉讼时效抗辩权。

3. 处理建议：

   • 鉴于借款时间已经较长，建议双方（即债权人和事业单位）先尝试通过协商的方式解决。协商可以更加灵活地处理还款问题，避免法律纠纷带来的不必要的成本和风险。
   • 如果协商无果，债权人可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。但需要注意的是，由于已经超过了最长诉讼时效，债权人可能会面临一定的法律风险。

4. 特殊情况考虑：

   • 如果事业单位在借款期间存在欺诈、隐瞒等违法行为，或者借款本身就存在违法性，那么债权人可能需要通过其他法律途径来追究事业单位的责任。
   • 另外，如果事业单位在借款后发生了重组、合并、分立等变更情况，也需要考虑这些变更对借款合同和还款责任的影响。

综上所述，对于事业单位长期借款超过20年的处理，需要综合考虑借款合同的具体内容、诉讼时效的规定以及双方的实际情况。建议双方先通过协商的方式解决，如果协商无果，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。同时，也需要注意法律风险和可能的变更情况对借款合同和还款责任的影响。