行政机关就同一案件重复立案确实违反了禁止重复的原则。以下是对这一问题的详细分析：

1. 禁止重复立案的原则：

   • 在行政执法中，禁止重复立案是一项基本原则，旨在确保行政执法的公正性、效率和权威性。重复立案不仅会导致行政资源的浪费，还可能给当事人带来不必要的困扰和负担。

2. 重复立案的违法性：

   • 行政机关就同一案件重复立案，违反了行政执法的程序规定和效率原则。根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规，行政机关在发现违法行为后，应当及时进行调查处理，并作出相应的行政处罚决定。如果同一案件被多个行政机关重复立案，或者同一行政机关对同一案件进行多次立案，都构成了对禁止重复立案原则的违反。

3. 重复立案的法律后果：

   • 重复立案可能导致行政处罚决定的重复作出，给当事人带来双重处罚的风险。这不仅违反了“一事不再罚”的原则，也损害了当事人的合法权益。同时，重复立案还可能影响行政执法的公信力和权威性，降低公众对行政执法的信任度。

4. 应对措施与建议：

   • 对于当事人而言，如果发现行政机关就同一案件重复立案，可以向相关行政机关提出异议，并要求其撤销重复的立案决定。如果行政机关不予理睬或处理不当，当事人还可以依法向上一级行政机关或司法机关申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
   • 对于行政机关而言，应当加强内部管理和监督，确保行政执法的公正性和效率性。在立案前，应当进行充分的调查和审查，避免重复立案的情况发生。同时，对于已经发生的重复立案情况，应当及时进行纠正和处理，以维护行政执法的公信力和权威性。

综上所述，行政机关就同一案件重复立案确实违反了禁止重复的原则，并可能带来一系列的法律后果。因此，行政机关在行政执法过程中应当严格遵守相关法律法规和程序规定，确保行政执法的公正性、效率和权威性。如果您有关于行政执法方面的法律问题，可以直接向我咨询。