在被告单位诉讼代表人与被告人共同参与庭审的情况下，二者通常是分别进行问话的。以下从法律背景、实际操作及可能的情况进行详细分析：

1. 法律背景与原则：

   • 在刑事诉讼中，被告单位诉讼代表人代表被告单位出庭，而被告人则是直接涉及犯罪行为的自然人。两者在诉讼中的地位和角色不同，因此，在庭审过程中，为了确保诉讼的公正性和效率，通常会分别对被告单位诉讼代表人和被告人进行问话。
   • 分别问话有助于法庭更清晰地了解被告单位和被告人的具体情况，以及他们在案件中的角色和责任。

2. 实际操作：

   • 在庭审过程中，法庭会根据案件的具体情况和需要，安排对被告单位诉讼代表人和被告人的问话顺序和方式。
   • 通常情况下，法庭会先对被告单位诉讼代表人进行问话，以了解被告单位的基本情况、对指控的看法以及是否有相关证据或辩护意见。
   • 随后，法庭会对被告人进行问话，以了解其个人情况、对指控的承认或否认、是否有相关证据或辩护意见等。

3. 可能的情况：

   • 在某些特殊情况下，如被告单位诉讼代表人和被告人对同一事实或证据有共同陈述或辩护意见时，法庭可能会安排他们同时或交替进行问话，以节省时间并提高效率。
   • 然而，这种情况并不常见，且通常需要法庭根据案件的具体情况和需要来决定。

4. 法律建议：

   • 对于被告单位诉讼代表人和被告人来说，在庭审过程中应分别准备自己的陈述和辩护意见，以确保能够清晰、准确地表达自己的立场和观点。
   • 同时，他们也应积极配合法庭的问话程序，如实回答法庭的问题，并提供相关证据或辩护意见以支持自己的立场。

综上所述，被告单位诉讼代表人与被告人在庭审时通常是分别进行问话的。这一做法有助于确保诉讼的公正性和效率，并使法庭能够更清晰地了解案件的具体情况。如有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。