征地批文超过两年后开发商来施工是否合法，需分情况讨论：

1. 若征地批文已失效，则开发商施工不合法：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，征地批文通常具有一定的有效期，一般为两年。若征地批文超过两年未实施征地或未完成相关征地程序，该批文可能自动失效。在此情况下，开发商若依据已失效的批文进行施工，将构成违法行为。
   • 法律后果：开发商可能面临行政处罚，包括但不限于罚款、责令停止施工等。同时，若因施工给被征地人造成损失，开发商还需承担相应的民事赔偿责任。

2. 若征地批文虽超过两年但已依法延期或重新获批，则开发商施工可能合法：

   • 在某些情况下，征地批文可能因特殊原因（如政策调整、项目变更等）而依法延期或重新获批。若开发商在征地批文延期或重新获批后进行施工，且施工行为符合相关法律法规和征地批文的要求，则其施工行为可能合法。
   • 注意事项：即便征地批文已延期或重新获批，开发商在施工前仍需确保已取得所有必要的施工许可和手续，并严格按照征地批文和相关法律法规的要求进行施工。

3. 若征地批文存在争议或未依法公开，则开发商施工的合法性需进一步审查：

   • 在实践中，可能存在征地批文存在争议或未依法公开的情况。在此情况下，开发商施工的合法性需根据具体情况进行进一步审查。例如，若被征地人对征地批文的合法性提出质疑，并已通过法律途径进行维权，则开发商在施工前需确保已妥善解决相关争议，并取得被征地人的同意或相关部门的批准。
   • 法律建议：对于此类情况，建议开发商在施工前进行充分的法律尽职调查，确保施工行为的合法性。同时，被征地人若对征地批文的合法性存在质疑，也应及时向相关部门反映或寻求法律援助。

综上所述，征地批文超过两年后开发商来施工是否合法，需根据征地批文的具体情况、是否已依法延期或重新获批、以及是否存在争议或未依法公开等因素进行综合判断。若您对征地拆迁相关法律问题存在疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。