针对您提出的问题“男子与军人配偶同居致其怀孕怎么处理”，这确实是一个涉及法律和道德层面的严肃问题。根据我国《中华人民共和国刑法》的相关规定，以及实际发生的案例，我可以为您详细解答。

首先，从法律角度来看，破坏军婚是严重的违法行为。《中华人民共和国刑法》第二百五十九条明确规定：“明知是现役军人的配偶而与之同居或者结婚的，处三年以下有期徒刑或者拘役。”这意味着，如果一名男子明知对方是现役军人的配偶，却仍然与其保持同居关系，甚至导致其怀孕，那么他将面临法律的制裁。

在实际案例中，如您所提到的赣州市中级人民法院对于都警方破获的方某破坏军婚案，以及江西高院发布的王某某破坏军婚案，都充分说明了这一点。在这些案例中，犯罪嫌疑人明知对方是现役军人的配偶，却仍然与其同居并导致其怀孕，最终都被法院以破坏军婚罪判处了相应的刑罚。

其次，从道德层面来看，这种行为也是极其不道德的。军人为了国家的安全和稳定，付出了巨大的努力和牺牲，他们的配偶应该得到尊重和保护。任何破坏军婚的行为，都是对军人及其家庭的极大伤害，也是对社会公序良俗的严重挑战。

因此，对于您提出的问题，我的建议是：如果发现有人与军人配偶同居并导致其怀孕，应该立即向相关部门举报，让法律来制裁这种违法行为。同时，我们也应该加强道德教育，提高全社会的道德水平，共同维护军人的合法权益和社会的公序良俗。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。