针对您提出的“人在上班但是没有打卡扣钱是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动法规和公司规章制度的重要议题。下面，我将从法律角度和实际操作层面，为您详细解答。

首先，从法律层面来看，公司无权直接对员工进行罚款。根据我国《中华人民共和国立法法》和《中华人民共和国行政处罚法》的规定，对财产的处罚只能由法律、法规和规章设定，且罚款处罚实行罚款机关与收缴罚款机构分离的制度。这意味着，只有行政机关才有罚款的权力，而私企作为以营利为目的的经济组织，在规章制度中设定罚款条款本身于法无据，无权做出罚款的决定。

然而，在实际操作中，许多公司都会制定考勤制度，并将考勤结果与工资发放挂钩。这种情况下，如果员工未打卡，公司可能会根据规章制度扣除相应的工资或奖金。但这里的关键在于，公司必须确保其考勤制度合法、合理，并且已经向员工进行了充分的告知和培训。

具体到您的情况，如果人在上班但因客观原因（如企业微信账号被停用、考勤机器故障等）无法打卡，公司应当进行核实并作出合理处理，而不是直接扣钱。因为未参加考勤不能等同于未正常出勤，也不能直接导致被扣发工资的必然后果。只有当劳动者无正当理由未正常上班导致的未参加考勤，才能被认定为无故缺勤，并可能扣发工资。

此外，如果公司确实因为员工未打卡而扣除了工资，员工有权向公司提出异议，并要求公司提供合理的解释和证据。如果公司无法提供充分的证据证明其扣款行为的合法性，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

综上所述，人在上班但没有打卡扣钱是否合法，取决于公司的考勤制度是否合法、合理，以及公司是否已经向员工进行了充分的告知和培训。如果公司存在违法行为或不合理规定，员工有权通过法律途径维护自己的权益。因此，建议您先与公司沟通，了解具体情况和扣款原因，如果无法达成一致，再考虑通过法律途径解决。