针对您提出的“协议上对于未及时结算的项目明确表示过期作废怎么办”这一问题，以下是我的详细分析和建议：

1. 协议条款的法律效力：

   • 首先，需要明确的是，协议中的条款，只要不违反法律法规的强制性规定，且是双方真实意思的表示，那么该条款就是具有法律效力的。因此，如果协议中明确规定了未及时结算的项目过期作废，那么这一条款在法律上是有效的。

2. 过期作废的法律后果：

   • 当项目因未及时结算而过期作废时，根据协议条款，该项目的相关权益（如付款请求权等）将不再存在。这意味着，如果一方在项目过期后仍试图主张相关权益，另一方有权依据协议条款进行抗辩，拒绝履行相关义务。

3. 应对策略与建议：

   • 及时结算：为了避免项目过期作废，双方应严格按照协议约定的时间进行结算。如果因特殊情况无法按时结算，应及时与对方沟通，寻求延期结算的解决方案，并尽可能以书面形式确认延期结算的协议。
   • 审查协议条款：在签订协议前，双方应仔细审查协议条款，特别是关于结算时间、过期作废等关键条款。如果发现条款存在不合理或模糊之处，应及时与对方协商修改，以确保协议条款的公平性和明确性。
   • 法律救济途径：如果项目因未及时结算而已经过期作废，且双方无法就后续处理达成一致，受损方可以考虑通过法律途径寻求救济。例如，可以依据协议中的争议解决条款（如仲裁或诉讼）来维护自己的合法权益。但需要注意的是，法律救济途径可能存在一定的成本和风险，因此应谨慎选择。

4. 特殊情况考虑：

   • 在某些特殊情况下，如因不可抗力因素导致无法按时结算，双方可以根据实际情况协商调整结算时间或采取其他补救措施。但这种情况下，双方应尽可能以书面形式确认相关协议，以避免后续产生纠纷。

综上所述，面对协议中关于未及时结算项目过期作废的条款，双方应严格遵守协议约定，及时结算以避免权益受损。如果因特殊情况无法按时结算，应及时与对方沟通并寻求解决方案。如有必要，可以寻求我的法律咨询以维护自己的合法权益。