针对您提出的“员工不知道是非法集资怎么办”这一问题，我会从法律角度和实际操作层面为您详细解答。
首先，从法律层面来看，员工在不知情且未实质参与非法集资活动的情况下，通常是不需要承担刑事责任的。这是因为，在非法集资案件中，员工的法律责任主要取决于他们在案件中的角色和参与度。如果员工对非法集资行为一无所知，且没有参与策划、组织或执行相关活动，那么他们就不构成共犯，自然无需承担刑事责任。
然而，这并不意味着员工可以完全置身事外。在案件发生后，员工可能需要配合相关部门的调查工作，提供必要的证据和信息。这是每个公民应尽的义务，也是为了维护社会的公平正义和法律的尊严。
接下来，从实际操作层面来看，如果员工发现自己所在的公司可能存在非法集资行为，但自己并不知情，那么应该采取以下措施：
保持冷静，不要惊慌：首先，要冷静下来，不要因为一时的恐慌而做出错误的决定。
收集证据：尽可能收集与非法集资行为相关的证据，如公司文件、聊天记录、转账记录等。这些证据在后续的调查中可能会起到关键作用。
主动配合调查：如果相关部门要求员工配合调查，应该积极响应，提供必要的协助和信息。这有助于加快案件的侦破进程，也有助于员工证明自己的清白。
寻求法律帮助：如果员工对法律程序不熟悉，或者担心自己的权益受到侵害，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询和代理服务，帮助员工维护自己的合法权益。
最后，我想强调的是，预防非法集资行为的发生比事后处理更为重要。作为员工，应该时刻保持警惕，增强法律意识，不参与任何违法违规的活动。同时，公司也应该加强内部管理，建立健全的风险防控机制，确保公司的经营活动合法合规。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。